SKILLEMALL.ai
GitHub ↗ EN Войти

BB bio-basecalling

Конвертирует необработанные данные сигналов Nanopore (FAST5/POD5) в нуклеотидные последовательности с помощью бейскаллера Dorado. Охватывает выбор модели, ускорение на GPU, обнаружение модифицированных оснований и фильтрацию по качеству. Используйте для обработки необработанных данных Nanopore перед выравниванием. Guppy устарел; используйте Dorado для всех новых анализов.

машинный переводПоказать оригиналСкрыть оригинал«Convert raw Nanopore signal data (FAST5/POD5) to nucleotide sequences…»

Convert raw Nanopore signal data (FAST5/POD5) to nucleotide sequences using Dorado basecaller. Covers model selection, GPU acceleration, modified base detection, and quality filtering. Use when processing raw Nanopore data before alignment. Guppy is deprecated; use Dorado for all new analyses.

FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills Agent Skills автор: FreedomIntelligence 4 файла · 2 скрипта тело ≈ 1 945 токенов Открыть источникgithub.com↗ проанализирован 11 ч назад

Конвертирует необработанные данные сигналов Nanopore (FAST5/POD5) в нуклеотидные последовательности с помощью бейскаллера Dorado.

Как процесс B 65/100 · Почти готов — слабые места: когда включается, входы и предусловия, отчётность по ходу

ГенераторИнфраструктураТексты и документытип и темы размечены автоматически по тексту скилла
Запускается в: Claude / Claude Code ChatGPT / Codex Gemini CLI Cursor GitHub Copilot / VS Code Qwen Code Kimi Code CLI Z.ai (GLM) DeepSeek (Deep Code) Mistral Vibe LangChain (deepagents) OpenClaw Goose OpenCode
JSON
Технический рейтинг
B
94/100
безопасность, качество, тесты
Безопасность 60%
100
Качество 40%
85
Прогон на моделях
не было
Процессный рейтинг
B
65/100
Почти готов
Входы и предусловия вес 11
0
Отчётность по ходу вес 2
0
Когда включается вес 12
20
три самых слабых из десяти параметров · все десять

Как улучшить

    Для прогона на моделях — необязательно
    • Свои кейсы (evals/evals.json, 4–6 реальных запросов с ожидаемыми ответами): тогда полная проверка прогонит именно их, а не черновик от модели.
    • spec.yaml с триггерными фразами и утверждениями — контракт поведения для CI; `skilltest init` создаст шаблон.

    Находки guard · 0

    ✓ Критических и высоких находок нет

    Просканировано файлов: 4. Улики замаскированы. Пометки в серых чипах объясняют, почему серьёзность понижена.

    По спецификации Agent Skills

    • заметка frontmatter-key неизвестное поле фронтматтера "tool_type"
    • заметка frontmatter-key неизвестное поле фронтматтера "primary_tool"
    • заметка edit-residue в тексте есть пометки об устаревшем (строки 112, 114, 283): проверьте, не остались ли старые правила рядом с новыми — полная проверка читает текст на противоречия

    Процессный рейтинг: все десять параметров 65/100

    • 0Входы и предусловия. Не сказано, что нужно иметь на входе
    • 0Отчётность по ходу. Скилл ничего не сообщает по ходу работы
    • 20Когда включается. Не сказано, при каком запросе скилл включается
    • 50Ошибки и развилки. Развилок: 0, есть раздел про ошибки
    • 60Результат и критерий готовности. Формат результата описан, критерия завершения нет
    • 85Шаги. Шагов: 6, расплывчатых формулировок: 1
    • 100Инструменты и файлы. Внешние инструменты не нужны
    • 100Согласованность. Имя и обязательные поля на месте
    • 100Стоимость исполнения. Тело инструкции 1945 токенов
    • 100Повторный запуск. Изменяющих операций нет
    • low Разделов верхнего уровня: 11. Похоже на несколько доменов в одном скилле

    Всё перечисленное измерено по тексту скилла, а не оценено моделью: цифры проверяемы. Вес параметра тем больше, чем чаще из-за него процесс встаёт.

    Сигналы качества

    • +5В description нет примеров фраз, по которым скилл должен срабатывать
    • +4Описание не говорит, когда скилл НЕ применять (ложные срабатывания)
    • +1Лицензия не указана
    • +2Инструкции на одном языке
    • +3Длина description 294 символов: достаточно сигнала, не съедает бюджет
    • +4Структура: 48 заголовков
    • +3Пошаговые инструкции: 6 пунктов
    • +3Формат ответа описан явно
    • +4Есть примеры (34 блоков кода)

    База качества 70; замечания lint вычитаются, сигналы прибавляют до 100. Итог: 85.