BC bio-cfdna-preprocessing
Предварительная обработка данных секвенирования внеклеточной ДНК, включая обрезку адаптеров, выравнивание, оптимизированное для коротких фрагментов, и удаление дубликатов с учетом UMI с помощью fgbio. Применяет специфичные для cfDNA пороговые значения качества и фильтрацию по длине фрагментов. Используйте при обработке данных секвенирования плазменной cfDNA перед последующим анализом.
машинный переводПоказать оригиналСкрыть оригинал«Preprocesses cell-free DNA sequencing data including adapter trimming,…»
Preprocesses cell-free DNA sequencing data including adapter trimming, alignment optimized for short fragments, and UMI-aware duplicate removal using fgbio. Applies cfDNA-specific quality thresholds and fragment length filtering. Use when processing plasma cfDNA sequencing data before downstream analysis.
Предварительная обработка данных секвенирования внеклеточной ДНК, включая обрезку адаптеров, выравнивание, оптимизированное для коротких фрагментов, и…
Как процесс C 51/100 · Есть пробелы — слабые места: результат и критерий готовности, когда включается, входы и предусловия
Как улучшить
- Свои кейсы (evals/evals.json, 4–6 реальных запросов с ожидаемыми ответами): тогда полная проверка прогонит именно их, а не черновик от модели.
- spec.yaml с триггерными фразами и утверждениями — контракт поведения для CI; `skilltest init` создаст шаблон.
Находки guard · 0
✓ Критических и высоких находок нет
Просканировано файлов: 3. Улики замаскированы. Пометки в серых чипах объясняют, почему серьёзность понижена.
По спецификации Agent Skills
- заметка
frontmatter-keyнеизвестное поле фронтматтера "tool_type" - заметка
frontmatter-keyнеизвестное поле фронтматтера "primary_tool"
Процессный рейтинг: все десять параметров 51/100
- 0Результат и критерий готовности. Не сказано, что считать результатом
- 0Входы и предусловия. Не сказано, что нужно иметь на входе
- 0Отчётность по ходу. Скилл ничего не сообщает по ходу работы
- 20Когда включается. Не сказано, при каком запросе скилл включается
- 50Ошибки и развилки. Развилок: 0, есть раздел про ошибки
- 60Инструменты и файлы. Используются инструменты (python), но во frontmatter они не объявлены
- 100Шаги. Шагов: 6
- 100Согласованность. Имя и обязательные поля на месте
- 100Стоимость исполнения. Тело инструкции 1505 токенов
- 100Повторный запуск. Изменяющих операций нет
Всё перечисленное измерено по тексту скилла, а не оценено моделью: цифры проверяемы. Вес параметра тем больше, чем чаще из-за него процесс встаёт.
Сигналы качества
- +5В description нет примеров фраз, по которым скилл должен срабатывать
- +4Описание не говорит, когда скилл НЕ применять (ложные срабатывания)
- +3Формат ответа не описан: модель каждый раз решает сама
- +1Лицензия не указана
- +2Инструкции на одном языке
- +3Длина description 306 символов: достаточно сигнала, не съедает бюджет
- +4Структура: 8 заголовков
- +3Пошаговые инструкции: 6 пунктов
- +4Есть примеры (3 блоков кода)
База качества 70; замечания lint вычитаются, сигналы прибавляют до 100. Итог: 82.