BB bio-chipseq-peak-calling
Поиск пиков ChIP-seq с помощью MACS3 (или MACS2). Ищет узкие пики для факторов транскрипции или широкие пики для модификаций гистонов. Поддерживает контроль входных данных, моделирование размера фрагментов и различные выходные форматы, включая файлы BED narrowPeak и broadPeak. Используйте при поиске пиков из выравниваний ChIP-seq.
машинный переводПоказать оригиналСкрыть оригинал«ChIP-seq peak calling using MACS3 (or MACS2). Call narrow peaks for tr…»
ChIP-seq peak calling using MACS3 (or MACS2). Call narrow peaks for transcription factors or broad peaks for histone modifications. Supports input control, fragment size modeling, and various output formats including narrowPeak and broadPeak BED files. Use when calling peaks from ChIP-seq alignments.
Поиск пиков ChIP-seq с помощью MACS3 (или MACS2).
Как процесс B 67/100 · Почти готов — слабые места: когда включается, входы и предусловия, отчётность по ходу
Как улучшить
- Свои кейсы (evals/evals.json, 4–6 реальных запросов с ожидаемыми ответами): тогда полная проверка прогонит именно их, а не черновик от модели.
- spec.yaml с триггерными фразами и утверждениями — контракт поведения для CI; `skilltest init` создаст шаблон.
Находки guard · 0
✓ Критических и высоких находок нет
Просканировано файлов: 3. Улики замаскированы. Пометки в серых чипах объясняют, почему серьёзность понижена.
По спецификации Agent Skills
- заметка
frontmatter-keyнеизвестное поле фронтматтера "tool_type" - заметка
frontmatter-keyнеизвестное поле фронтматтера "primary_tool" - заметка
edit-residueв тексте есть пометки об устаревшем (строки 29): проверьте, не остались ли старые правила рядом с новыми — полная проверка читает текст на противоречия
Процессный рейтинг: все десять параметров 67/100
- 0Входы и предусловия. Не сказано, что нужно иметь на входе
- 0Отчётность по ходу. Скилл ничего не сообщает по ходу работы
- 20Когда включается. Не сказано, при каком запросе скилл включается
- 50Ошибки и развилки. Развилок: 0, есть раздел про ошибки
- 60Результат и критерий готовности. Формат результата описан, критерия завершения нет
- 100Инструменты и файлы. Внешние инструменты не нужны
- 100Шаги. Шагов: 6
- 100Согласованность. Имя и обязательные поля на месте
- 100Стоимость исполнения. Тело инструкции 1944 токенов
- 100Повторный запуск. Изменяющих операций нет
- low Разделов верхнего уровня: 18. Похоже на несколько доменов в одном скилле
Всё перечисленное измерено по тексту скилла, а не оценено моделью: цифры проверяемы. Вес параметра тем больше, чем чаще из-за него процесс встаёт.
Сигналы качества
- +5В description нет примеров фраз, по которым скилл должен срабатывать
- +4Описание не говорит, когда скилл НЕ применять (ложные срабатывания)
- +1Лицензия не указана
- +2Инструкции на одном языке
- +3Длина description 301 символов: достаточно сигнала, не съедает бюджет
- +4Структура: 19 заголовков
- +3Пошаговые инструкции: 6 пунктов
- +3Формат ответа описан явно
- +4Есть примеры (13 блоков кода)
База качества 70; замечания lint вычитаются, сигналы прибавляют до 100. Итог: 85.