SKILLEMALL.ai
GitHub ↗ EN Войти

BC bio-microbiome-qiime2-workflow

Инструмент командной строки QIIME2 для анализа ампликонов 16S/ITS. Альтернатива рабочему процессу R DADA2/phyloseq со встроенным отслеживанием происхождения. Используйте, если предпочитаете CLI вместо R, вам нужно воспроизводимое отслеживание происхождения или вы работаете в экосистеме QIIME2.

машинный переводПоказать оригиналСкрыть оригинал«QIIME2 command-line workflow for 16S/ITS amplicon analysis. Alternativ…»

QIIME2 command-line workflow for 16S/ITS amplicon analysis. Alternative to DADA2/phyloseq R workflow with built-in provenance tracking. Use when preferring CLI over R, needing reproducible provenance, or working within QIIME2 ecosystem.

FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills Agent Skills автор: FreedomIntelligence 3 файла · 1 скрипт тело ≈ 1 472 токенов Открыть источникgithub.com↗ проанализирован 14 ч назад

Инструмент командной строки QIIME2 для анализа ампликонов 16S/ITS.

Как процесс C 53/100 · Есть пробелы — слабые места: результат и критерий готовности, когда включается, входы и предусловия

ПроцедураРазработкаДанные и аналитикаТексты и документытип и темы размечены автоматически по тексту скилла
Запускается в: Claude / Claude Code ChatGPT / Codex Gemini CLI Cursor GitHub Copilot / VS Code Qwen Code Kimi Code CLI Z.ai (GLM) DeepSeek (Deep Code) Mistral Vibe LangChain (deepagents) OpenClaw Goose OpenCode
JSON
Технический рейтинг
B
92/100
безопасность, качество, тесты
Безопасность 60%
98
Качество 40%
82
Прогон на моделях
не было
Процессный рейтинг
C
53/100
Есть пробелы
Результат и критерий готовности вес 14
0
Входы и предусловия вес 11
0
Когда включается вес 12
20
три самых слабых из десяти параметров · все десять

Как улучшить

    Для прогона на моделях — необязательно
    • Свои кейсы (evals/evals.json, 4–6 реальных запросов с ожидаемыми ответами): тогда полная проверка прогонит именно их, а не черновик от модели.
    • spec.yaml с триггерными фразами и утверждениями — контракт поведения для CI; `skilltest init` создаст шаблон.

    Находки guard · 2

    ✓ Критических и высоких находок нет

    Средние и низкие: 2
    • низкая Секреты в коде secret-high-entropy-token examples/qiime2_16s.sh:22
      Строка, похожая на токен (может быть id, хеш или секрет) (тестовый файл / пример)
      --input-format Pair…3V2
      тестовый файл
    • низкая Секреты в коде secret-high-entropy-token SKILL.md:31
      Строка, похожая на токен (может быть id, хеш или секрет)
      --input-format Pair…3V2

    Просканировано файлов: 3. Улики замаскированы. Пометки в серых чипах объясняют, почему серьёзность понижена.

    По спецификации Agent Skills

    • заметка frontmatter-key неизвестное поле фронтматтера "tool_type"
    • заметка frontmatter-key неизвестное поле фронтматтера "primary_tool"

    Процессный рейтинг: все десять параметров 53/100

    • 0Результат и критерий готовности. Не сказано, что считать результатом
    • 0Входы и предусловия. Не сказано, что нужно иметь на входе
    • 20Когда включается. Не сказано, при каком запросе скилл включается
    • 50Ошибки и развилки. Развилок: 0, есть раздел про ошибки
    • 60Инструменты и файлы. Используются инструменты (python), но во frontmatter они не объявлены
    • 100Шаги. Шагов: 6
    • 100Согласованность. Имя и обязательные поля на месте
    • 100Стоимость исполнения. Тело инструкции 1472 токенов
    • 100Повторный запуск. Изменяющих операций нет
    • 100Отчётность по ходу. Скилл сообщает о ходе работы
    • low Разделов верхнего уровня: 12. Похоже на несколько доменов в одном скилле

    Всё перечисленное измерено по тексту скилла, а не оценено моделью: цифры проверяемы. Вес параметра тем больше, чем чаще из-за него процесс встаёт.

    Сигналы качества

    • +5В description нет примеров фраз, по которым скилл должен срабатывать
    • +4Описание не говорит, когда скилл НЕ применять (ложные срабатывания)
    • +3Формат ответа не описан: модель каждый раз решает сама
    • +1Лицензия не указана
    • +2Инструкции на одном языке
    • +3Длина description 236 символов: достаточно сигнала, не съедает бюджет
    • +4Структура: 13 заголовков
    • +3Пошаговые инструкции: 6 пунктов
    • +4Есть примеры (10 блоков кода)

    База качества 70; замечания lint вычитаются, сигналы прибавляют до 100. Итог: 82.