BB bio-splicing-quantification
Количественно определяет альтернативные события сплайсинга (PSI/процент сплайсинга) из РНК-секвенирования с помощью SUPPA2 из TPM транскриптов или rMATS-turbo из файлов BAM. Рассчитывает уровни включения для пропущенных экзонов, альтернативных сайтов сплайсинга, взаимоисключающих экзонов и интронов, которые остаются. Используйте при измерении использования сайтов сплайсинга или соотношений изоформ из данных РНК-секвенирования.
машинный переводПоказать оригиналСкрыть оригинал«Quantifies alternative splicing events (PSI/percent spliced in) from R…»
Quantifies alternative splicing events (PSI/percent spliced in) from RNA-seq using SUPPA2 from transcript TPM or rMATS-turbo from BAM files. Calculates inclusion levels for skipped exons, alternative splice sites, mutually exclusive exons, and retained introns. Use when measuring splice site usage or isoform ratios from RNA-seq data.
Количественно определяет альтернативные события сплайсинга (PSI/процент сплайсинга) из РНК-секвенирования с помощью SUPPA2 из TPM транскриптов или rMATS-turbo…
Как процесс B 67/100 · Почти готов — слабые места: когда включается, входы и предусловия, отчётность по ходу
Как улучшить
- Свои кейсы (evals/evals.json, 4–6 реальных запросов с ожидаемыми ответами): тогда полная проверка прогонит именно их, а не черновик от модели.
- spec.yaml с триггерными фразами и утверждениями — контракт поведения для CI; `skilltest init` создаст шаблон.
Находки guard · 0
✓ Критических и высоких находок нет
Просканировано файлов: 3. Улики замаскированы. Пометки в серых чипах объясняют, почему серьёзность понижена.
По спецификации Agent Skills
- заметка
frontmatter-keyнеизвестное поле фронтматтера "tool_type" - заметка
frontmatter-keyнеизвестное поле фронтматтера "primary_tool"
Процессный рейтинг: все десять параметров 67/100
- 0Входы и предусловия. Не сказано, что нужно иметь на входе
- 0Отчётность по ходу. Скилл ничего не сообщает по ходу работы
- 20Когда включается. Не сказано, при каком запросе скилл включается
- 50Ошибки и развилки. Развилок: 0, есть раздел про ошибки
- 60Результат и критерий готовности. Формат результата описан, критерия завершения нет
- 100Инструменты и файлы. Внешние инструменты не нужны
- 100Шаги. Шагов: 16
- 100Согласованность. Имя и обязательные поля на месте
- 100Стоимость исполнения. Тело инструкции 1154 токенов
- 100Повторный запуск. Изменяющих операций нет
Всё перечисленное измерено по тексту скилла, а не оценено моделью: цифры проверяемы. Вес параметра тем больше, чем чаще из-за него процесс встаёт.
Сигналы качества
- +5В description нет примеров фраз, по которым скилл должен срабатывать
- +4Описание не говорит, когда скилл НЕ применять (ложные срабатывания)
- +1Лицензия не указана
- +2Инструкции на одном языке
- +3Длина description 335 символов: достаточно сигнала, не съедает бюджет
- +4Структура: 11 заголовков
- +3Пошаговые инструкции: 16 пунктов
- +3Формат ответа описан явно
- +4Есть примеры (3 блоков кода)
База качества 70; замечания lint вычитаются, сигналы прибавляют до 100. Итог: 85.