SKILLEMALL.ai
GitHub ↗ EN Войти

BF bulk-rna-seq-batch-correction-with-combat

Используйте обертку pyComBat от omicverse для удаления пакетных эффектов из объединенных когорт bulk RNA-seq или микрочипов, экспорта скорректированных матриц и сравнения визуализаций до и после коррекции.

машинный переводПоказать оригиналСкрыть оригинал«Use omicverse's pyComBat wrapper to remove batch effects from merged b…»

Use omicverse's pyComBat wrapper to remove batch effects from merged bulk RNA-seq or microarray cohorts, export corrected matrices, and benchmark pre/post correction visualisations.

FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills Agent Skills автор: FreedomIntelligence 2 файла тело ≈ 861 токенов Открыть источникgithub.com↗ проанализирован 14 ч назад

Используйте обертку pyComBat от omicverse для удаления пакетных эффектов из объединенных когорт bulk RNA-seq или микрочипов, экспорта скорректированных матриц…

Как процесс F 30/100 · Процесс не описан — Скилл ссылается на файлы, которых нет в архиве: ../../omicverse_guide/docs/Tutorials-bulk/t_bulk_combat.ipynb, ../../omicverse_guide/docs/Tutorials-bulk/data/combat/

ПроцедураДанные и аналитикаИИ и агентыОбучениетип и темы размечены автоматически по тексту скилла
Запускается в: Claude / Claude Code ChatGPT / Codex Gemini CLI Cursor GitHub Copilot / VS Code Qwen Code Kimi Code CLI Z.ai (GLM) DeepSeek (Deep Code) Mistral Vibe LangChain (deepagents) OpenClaw Goose OpenCode
JSON
Технический рейтинг
B
90/100
безопасность, качество, тесты
Безопасность 60%
100
Качество 40%
74
Прогон на моделях
не было
Процессный рейтинг
F
30/100
Процесс не описан
Скилл ссылается на файлы, которых нет в архиве: ../../omicverse_guide/docs/Tutorials-bulk/t_bulk_combat.ipynb, ../../omicverse_guide/docs/Tutorials-bulk/data/combat/
Инструменты и файлы вес 18
0
Результат и критерий готовности вес 14
0
Входы и предусловия вес 11
0
три самых слабых из десяти параметров · все десять

Как улучшить

  1. В тексте есть ссылки на отсутствующие файлы: добавьте файлы или уберите ссылки.
Для прогона на моделях — необязательно
  • Свои кейсы (evals/evals.json, 4–6 реальных запросов с ожидаемыми ответами): тогда полная проверка прогонит именно их, а не черновик от модели.
  • spec.yaml с триггерными фразами и утверждениями — контракт поведения для CI; `skilltest init` создаст шаблон.

Находки guard · 0

✓ Критических и высоких находок нет

Просканировано файлов: 2. Улики замаскированы. Пометки в серых чипах объясняют, почему серьёзность понижена.

По спецификации Agent Skills

  • предупреждение missing-ref ссылка на отсутствующий файл: ../../omicverse_guide/docs/Tutorials-bulk/t_bulk_combat.ipynb
  • предупреждение missing-ref ссылка на отсутствующий файл: ../../omicverse_guide/docs/Tutorials-bulk/data/combat/
  • заметка frontmatter-key неизвестное поле фронтматтера "title"

Процессный рейтинг: все десять параметров 30/100

Не запустится. Скилл ссылается на файлы, которых нет в архиве: ../../omicverse_guide/docs/Tutorials-bulk/t_bulk_combat.ipynb, ../../omicverse_guide/docs/Tutorials-bulk/data/combat/
  • 0Инструменты и файлы. Не хватает 2 файла(ов): ../../omicverse_guide/docs/Tutorials-bulk/t_bulk_combat.ipynb, ../../omicverse_guide/docs/Tutorials-bulk/data/combat/
  • 0Результат и критерий готовности. Не сказано, что считать результатом
  • 0Входы и предусловия. Не сказано, что нужно иметь на входе
  • 0Ошибки и развилки. Линейный процесс без обработки сбоев
  • 20Когда включается. Не сказано, при каком запросе скилл включается
  • 30Повторный запуск. Изменяющих операций: 1, без проверки текущего состояния
  • 40Согласованность. Имя во frontmatter (bulk-rna-seq-batch-correction-with-combat) не совпадает с папкой (bulk-combat-correction)
  • 100Шаги. Шагов: 31
  • 100Стоимость исполнения. Тело инструкции 861 токенов
  • 100Отчётность по ходу. Скилл сообщает о ходе работы

Всё перечисленное измерено по тексту скилла, а не оценено моделью: цифры проверяемы. Вес параметра тем больше, чем чаще из-за него процесс встаёт.

Сигналы качества

  • +5В description нет примеров фраз, по которым скилл должен срабатывать
  • +4Описание не говорит, когда скилл НЕ применять (ложные срабатывания)
  • +3Формат ответа не описан: модель каждый раз решает сама
  • +1Лицензия не указана
  • +2Инструкции на одном языке
  • +3Длина description 181 символов: достаточно сигнала, не съедает бюджет
  • +4Структура: 5 заголовков
  • +3Пошаговые инструкции: 31 пунктов
  • +4Есть примеры (0 блоков кода)

База качества 70; замечания lint вычитаются, сигналы прибавляют до 100. Итог: 74.