SKILLEMALL.ai
GitHub ↗ EN Войти

AB tooluniverse-rnaseq-deseq2

Готовый к производству анализ дифференциальной экспрессии РНК-сек с использованием PyDESeq2. Выполняет нормализацию DESeq2, оценку дисперсии, тест Вальда, сжатие LFC и фильтрацию результатов. Обрабатывает многофакторные конструкции, множественные контрасты, пакетные эффекты и интегрируется с инструментами обогащения генов (gseapy) и аннотации ToolUniverse (UniProt, Ensembl, OpenTargets). Поддерживает входные форматы CSV/TSV/H5AD и любой организм. Используйте при анализе матриц подсчета РНК-сек, выявлении DEGs, проведении дифференциальной экспрессии со статистической строгостью или при ответах на вопросы об изменениях экспрессии генов.

машинный переводПоказать оригиналСкрыть оригинал«Production-ready RNA-seq differential expression analysis using PyDESe…»

Production-ready RNA-seq differential expression analysis using PyDESeq2. Performs DESeq2 normalization, dispersion estimation, Wald testing, LFC shrinkage, and result filtering. Handles multi-factor designs, multiple contrasts, batch effects, and integrates with gene enrichment (gseapy) and ToolUniverse annotation tools (UniProt, Ensembl, OpenTargets). Supports CSV/TSV/H5AD input formats and any organism. Use when analyzing RNA-seq count matrices, identifying DEGs, performing differential expression with statistical rigor, or answering questions about gene expression changes.

FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills Agent Skills автор: FreedomIntelligence 18 файлов · 4 скрипта тело ≈ 4 291 токенов Открыть источникgithub.com↗ проанализирован 12 ч назад

Готовый к производству анализ дифференциальной экспрессии РНК-сек с использованием PyDESeq2.

Как процесс B 70/100 · Почти готов — слабые места: входы и предусловия, отчётность по ходу

АнализаторДанные и аналитикатип и темы размечены автоматически по тексту скилла
Запускается в: Claude / Claude Code ChatGPT / Codex Gemini CLI Cursor GitHub Copilot / VS Code Qwen Code Kimi Code CLI Z.ai (GLM) DeepSeek (Deep Code) Mistral Vibe LangChain (deepagents) OpenClaw Goose OpenCode
JSON
Технический рейтинг
A
95/100
безопасность, качество, тесты
Безопасность 60%
100
Качество 40%
88
Прогон на моделях
не было
Процессный рейтинг
B
70/100
Почти готов
Входы и предусловия вес 11
0
Отчётность по ходу вес 2
0
Инструменты и файлы вес 18
60
три самых слабых из десяти параметров · все десять

Как улучшить

    Для прогона на моделях — необязательно
    • Свои кейсы (evals/evals.json, 4–6 реальных запросов с ожидаемыми ответами): тогда полная проверка прогонит именно их, а не черновик от модели.
    • spec.yaml с триггерными фразами и утверждениями — контракт поведения для CI; `skilltest init` создаст шаблон.

    Находки guard · 0

    ✓ Критических и высоких находок нет

    Просканировано файлов: 17. Улики замаскированы. Пометки в серых чипах объясняют, почему серьёзность понижена.

    По спецификации Agent Skills

    ✓ По спецификации Agent Skills замечаний нет

    Процессный рейтинг: все десять параметров 70/100

    • 0Входы и предусловия. Не сказано, что нужно иметь на входе
    • 0Отчётность по ходу. Скилл ничего не сообщает по ходу работы
    • 60Инструменты и файлы. Используются инструменты (python), но во frontmatter они не объявлены
    • 60Результат и критерий готовности. Формат результата описан, критерия завершения нет
    • 70Стоимость исполнения. Тело инструкции 4291 токенов
    • 85Шаги. Шагов: 86, расплывчатых формулировок: 1
    • 100Когда включается. Сказано, когда применять и когда не применять
    • 100Ошибки и развилки. Развилок: 1, есть раздел про ошибки
    • 100Согласованность. Имя и обязательные поля на месте
    • 100Повторный запуск. Изменяющие операции проверяют текущее состояние
    • low Разделов верхнего уровня: 11. Похоже на несколько доменов в одном скилле

    Всё перечисленное измерено по тексту скилла, а не оценено моделью: цифры проверяемы. Вес параметра тем больше, чем чаще из-за него процесс встаёт.

    Сигналы качества

    • +5В description нет примеров фраз, по которым скилл должен срабатывать
    • +4Описание не говорит, когда скилл НЕ применять (ложные срабатывания)
    • -31 из 3 скриптов не упомянуты в SKILL.md
    • +1Лицензия не указана
    • +2Инструкции на одном языке
    • +3Длина description 583 символов: достаточно сигнала, не съедает бюджет
    • +4Структура: 29 заголовков
    • +3Пошаговые инструкции: 86 пунктов
    • +3Формат ответа описан явно
    • +4Есть примеры (18 блоков кода)
    • +4Справочные файлы упоминаются в инструкциях (9 из 9)

    База качества 70; замечания lint вычитаются, сигналы прибавляют до 100. Итог: 88.