BD tooluniverse-spatial-transcriptomics

Анализируйте пространственные транскриптомные данные для картирования экспрессии генов в тканевой архитектуре. Поддерживает платформы 10x Visium, MERFISH, seqFISH, Slide-seq и платформы на основе изображений. Выполняет пространственную кластеризацию, идентификацию доменов, анализ близости клеток, пространственные паттерны экспрессии генов, картирование тканевой архитектуры и интеграцию с одноклеточными данными. Используйте при анализе пространственных транскриптомных наборов данных, изучении организации тканей, выявлении пространственных паттернов экспрессии, картировании клеточных взаимодействий в тканевом контексте, характеристике пространственной структуры микроокружения опухоли или интеграции пространственных и одноклеточных данных RNA-seq для комплексного анализа тканей.

машинный переводПоказать оригиналСкрыть оригинал«Analyze spatial transcriptomics data to map gene expression in tissue…»

Analyze spatial transcriptomics data to map gene expression in tissue architecture. Supports 10x Visium, MERFISH, seqFISH, Slide-seq, and imaging-based platforms. Performs spatial clustering, domain identification, cell-cell proximity analysis, spatial gene expression patterns, tissue architecture mapping, and integration with single-cell data. Use when analyzing spatial transcriptomics datasets, studying tissue organization, identifying spatial expression patterns, mapping cell-cell interactions in tissue context, characterizing tumor microenvironment spatial structure, or integrating spatial and single-cell RNA-seq data for comprehensive tissue analysis.

Анализируйте пространственные транскриптомные данные для картирования экспрессии генов в тканевой архитектуре.

Как процесс D 49/100 · Процесс не доведён — слабые места: результат и критерий готовности, когда включается, входы и предусловия