SKILLEMALL.ai

AD molecular-dynamics

Запускает и анализирует симуляции молекулярной динамики с помощью OpenMM и MDAnalysis. Настраивает системы белок/малая молекула, определяет силовые поля, выполняет минимизацию энергии и продакшн-MD, а также анализирует траектории (RMSD, RMSF, карты контактов, поверхности свободной энергии). Для структурной биологии, связывания лекарств и биофизики.

машинный переводПоказать оригиналСкрыть оригинал«Runs and analyzes molecular dynamics simulations with OpenMM and MDAna…»

Runs and analyzes molecular dynamics simulations with OpenMM and MDAnalysis. Sets up protein/small molecule systems, defines force fields, runs energy minimization and production MD, and analyzes trajectories (RMSD, RMSF, contact maps, free energy surfaces). For structural biology, drug binding, and biophysics.

K-Dense-AI/claude-scientific-skills Agent Skills автор: K-Dense-AI MIT 3 файла тело ≈ 4 571 токенов Открыть источникgithub.com↗ проанализирован 11 ч назад

Запускает и анализирует симуляции молекулярной динамики с помощью OpenMM и MDAnalysis.

Как процесс D 42/100 · Процесс не доведён — слабые места: результат и критерий готовности, когда включается, входы и предусловия

АнализаторРазработкатип и темы размечены автоматически по тексту скилла
JSON
Технический рейтинг
A
96/100
безопасность, качество, тесты
Безопасность 60%
100
Качество 40%
89
Прогон на моделях
не было
Процессный рейтинг
D
42/100
Процесс не доведён
Результат и критерий готовности вес 14
0
Входы и предусловия вес 11
0
Ошибки и развилки вес 10
0
три самых слабых из десяти параметров · все десять

Как улучшить

    Для прогона на моделях — необязательно
    • Свои кейсы (evals/evals.json, 4–6 реальных запросов с ожидаемыми ответами): тогда полная проверка прогонит именно их, а не черновик от модели.
    • spec.yaml с триггерными фразами и утверждениями — контракт поведения для CI; `skilltest init` создаст шаблон.

    Находки guard · 0

    ✓ Критических и высоких находок нет

    Просканировано файлов: 3. Улики замаскированы. Пометки в серых чипах объясняют, почему серьёзность понижена.

    По спецификации Agent Skills

    ✓ По спецификации Agent Skills замечаний нет

    Процессный рейтинг: все десять параметров 42/100

    • 0Результат и критерий готовности. Не сказано, что считать результатом
    • 0Входы и предусловия. Не сказано, что нужно иметь на входе
    • 0Ошибки и развилки. Линейный процесс без обработки сбоев
    • 0Отчётность по ходу. Скилл ничего не сообщает по ходу работы
    • 20Когда включается. Не сказано, при каком запросе скилл включается
    • 30Повторный запуск. Изменяющих операций: 1, без проверки текущего состояния
    • 60Инструменты и файлы. Используются инструменты (python), но во frontmatter они не объявлены
    • 70Стоимость исполнения. Тело инструкции 4571 токенов
    • 100Шаги. Шагов: 24
    • 100Согласованность. Имя и обязательные поля на месте

    Всё перечисленное измерено по тексту скилла, а не оценено моделью: цифры проверяемы. Вес параметра тем больше, чем чаще из-за него процесс встаёт.

    Сигналы качества

    • +5В description нет примеров фраз, по которым скилл должен срабатывать
    • +4Описание не говорит, когда скилл НЕ применять (ложные срабатывания)
    • +3Формат ответа не описан: модель каждый раз решает сама
    • +2Инструкции на одном языке
    • +3Длина description 312 символов: достаточно сигнала, не съедает бюджет
    • +4Структура: 16 заголовков
    • +3Пошаговые инструкции: 24 пунктов
    • +4Есть примеры (9 блоков кода)
    • +4Справочные файлы упоминаются в инструкциях (2 из 2)
    • +1Лицензия указана

    База качества 70; замечания lint вычитаются, сигналы прибавляют до 100. Итог: 89.