SKILLEMALL.ai
GitHub ↗ EN Войти

BC qiime2-amplicon

Обрабатывает парные 16S ампликонные прочтения в ASV и таксономию QIIME 2 с сохранением происхождения артефактов. Проверяет парные манифесты FASTQ, диагностику ориентации праймеров, предполагаемый перехлест после обрезки, идентификаторы образцов, версии времени выполнения и сохранение прочтений, а также помогает в выборе совместимых таксономических классификаторов.

машинный переводПоказать оригиналСкрыть оригинал«Processes paired-end 16S amplicon reads into QIIME 2 ASVs and taxonomy…»

Processes paired-end 16S amplicon reads into QIIME 2 ASVs and taxonomy with retained artifact provenance. Checks paired FASTQ manifests, primer orientation diagnostics, predicted post-trimming overlap, sample IDs, runtime versions and read retention, and guides selection of compatible taxonomic classifiers.

K-Dense-AI/claude-scientific-skills Agent Skills автор: K-Dense-AI MIT 3 файла · 1 скрипт тело ≈ 1 949 токенов Открыть источникgithub.com↗ проанализирован 11 ч назад

Обрабатывает парные 16S ампликонные прочтения в ASV и таксономию QIIME 2 с сохранением происхождения артефактов.

Как процесс C 51/100 · Есть пробелы — слабые места: результат и критерий готовности, когда включается, ошибки и развилки

АнализаторДанные и аналитикаТексты и документыРазработкатип и темы размечены автоматически по тексту скилла
Запускается в: Claude / Claude Code ChatGPT / Codex Gemini CLI Cursor GitHub Copilot / VS Code Qwen Code Kimi Code CLI Z.ai (GLM) DeepSeek (Deep Code) Mistral Vibe LangChain (deepagents) OpenClaw Goose OpenCode
JSON
Технический рейтинг
B
90/100
безопасность, качество, тесты
Безопасность 60%
96
Качество 40%
80
Прогон на моделях
не было
Процессный рейтинг
C
51/100
Есть пробелы
Результат и критерий готовности вес 14
0
Ошибки и развилки вес 10
0
Когда включается вес 12
20
три самых слабых из десяти параметров · все десять

Как улучшить

  1. Скажите в description, КОГДА применять скилл («используй, когда…», примеры запросов): это главный сигнал для агента.
Для прогона на моделях — необязательно
  • Свои кейсы (evals/evals.json, 4–6 реальных запросов с ожидаемыми ответами): тогда полная проверка прогонит именно их, а не черновик от модели.
  • spec.yaml с триггерными фразами и утверждениями — контракт поведения для CI; `skilltest init` создаст шаблон.

Находки guard · 4

✓ Критических и высоких находок нет

Средние и низкие: 4
  • низкая Секреты в коде secret-high-entropy-token references/runtime-and-interpretation.md:45
    Строка, похожая на токен (может быть id, хеш или секрет) (строка таблицы в документации)
    | `tools import` | `SampleData[PairedEndSequencesWithQuality]`, format `Pair…3V2`; `.qza` output. The underlying V2 manifest is QIIME metadata; this helper accepts a narrower li
    таблица
  • низкая Секреты в коде secret-high-entropy-token scripts/amplicon_workflow.py:82
    Строка, похожая на токен (может быть id, хеш или секрет) (в кавычках — упоминание, а не команда)
    raise ValueError(f'Pair…3V2 requires tab-separated columns {fields}')
    в кавычках
  • низкая Секреты в коде secret-high-entropy-token scripts/amplicon_workflow.py:195
    Строка, похожая на токен (может быть id, хеш или секрет) (в кавычках — упоминание, а не команда)
    '--input-format', 'Pair…3V2', '--input-path', args.manifest.resolve(),
    в кавычках
  • низкая Секреты в коде secret-high-entropy-token SKILL.md:45
    Строка, похожая на токен (может быть id, хеш или секрет) (в кавычках — упоминание, а не команда)
    Manifest is a **tab-separated** `Pair…3V2` file with exactly these headers:
    в кавычках

Просканировано файлов: 3. Улики замаскированы. Пометки в серых чипах объясняют, почему серьёзность понижена.

По спецификации Agent Skills

  • предупреждение description-no-when description не говорит, КОГДА применять скилл (нет "use when / используй когда")

Процессный рейтинг: все десять параметров 51/100

  • 0Результат и критерий готовности. Не сказано, что считать результатом
  • 0Ошибки и развилки. Линейный процесс без обработки сбоев
  • 20Когда включается. Не сказано, при каком запросе скилл включается
  • 30Повторный запуск. Изменяющих операций: 2, без проверки текущего состояния
  • 60Инструменты и файлы. Используются инструменты (web), но во frontmatter они не объявлены
  • 70Входы и предусловия. Входные данные и предусловия перечислены
  • 85Шаги. Шагов: 8, расплывчатых формулировок: 1
  • 100Согласованность. Имя и обязательные поля на месте
  • 100Стоимость исполнения. Тело инструкции 1949 токенов
  • 100Отчётность по ходу. Скилл сообщает о ходе работы

Всё перечисленное измерено по тексту скилла, а не оценено моделью: цифры проверяемы. Вес параметра тем больше, чем чаще из-за него процесс встаёт.

Сигналы качества

  • +5В description нет примеров фраз, по которым скилл должен срабатывать
  • +4Описание не говорит, когда скилл НЕ применять (ложные срабатывания)
  • +3Формат ответа не описан: модель каждый раз решает сама
  • +2Инструкции на одном языке
  • +3Длина description 308 символов: достаточно сигнала, не съедает бюджет
  • +4Структура: 6 заголовков
  • +3Пошаговые инструкции: 8 пунктов
  • +4Есть примеры (3 блоков кода)
  • +4Справочные файлы упоминаются в инструкциях (1 из 1)
  • +3Все 1 скриптов описаны в инструкциях
  • +1Лицензия указана

База качества 70; замечания lint вычитаются, сигналы прибавляют до 100. Итог: 80.