SKILLEMALL.ai
GitHub ↗ EN Войти

AC waypoint-bio

Поддерживает работу с открытыми фундаментальными моделями микробиома от Outpost Bio — чекпоинтами Waypoint (Waypoint-6m, Waypoint-45m, Waypoint-170m), претренировочным корпусом Atlas, бенчмарком из восьми задач Compass или CLI `waypoint` из пакета `waypoint-bio`. Охватывает встраивание образцов микробиома, дообучение на данных таксономической распространенности, бенчмаркинг чекпоинта на Compass, претренировку модели GPT-2 на профилях таксономической распространенности и преобразование таблиц распространенности MetaPhlAn, Kraken2, QIIME 2 или MGnify в формат waypoint.

машинный переводПоказать оригиналСкрыть оригинал«Supports work with Outpost Bio's open microbiome foundation models - t…»

Supports work with Outpost Bio's open microbiome foundation models - the Waypoint checkpoints (Waypoint-6m, Waypoint-45m, Waypoint-170m), the Atlas pretraining corpus, the Compass eight-task benchmark, or the `waypoint` CLI from the `waypoint-bio` package. Covers embedding microbiome samples, fine-tuning on taxonomic abundance data, benchmarking a checkpoint on Compass, pretraining a GPT-2 model on taxonomic abundance profiles, and converting MetaPhlAn, Kraken2, QIIME 2, or MGnify abundance tables into waypoint format.

K-Dense-AI/claude-scientific-skills Agent Skills автор: K-Dense-AI MIT 8 файлов · 2 скрипта тело ≈ 3 846 токенов Открыть источникgithub.com↗ проанализирован 13 ч назад

Поддерживает работу с открытыми фундаментальными моделями микробиома от Outpost Bio — чекпоинтами Waypoint (Waypoint-6m, Waypoint-45m, Waypoint-170m)…

Как процесс C 50/100 · Есть пробелы — слабые места: результат и критерий готовности, когда включается, входы и предусловия

ИнтеграцияGitHubИИ и агентытип и темы размечены автоматически по тексту скилла
Запускается в: Claude / Claude Code ChatGPT / Codex Gemini CLI Cursor GitHub Copilot / VS Code Qwen Code Kimi Code CLI Z.ai (GLM) DeepSeek (Deep Code) Mistral Vibe LangChain (deepagents) OpenClaw Goose OpenCode
JSON
Технический рейтинг
A
97/100
безопасность, качество, тесты
Безопасность 60%
100
Качество 40%
92
Прогон на моделях
не было
Процессный рейтинг
C
50/100
Есть пробелы
Результат и критерий готовности вес 14
0
Входы и предусловия вес 11
0
Когда включается вес 12
20
три самых слабых из десяти параметров · все десять

Как улучшить

    Для прогона на моделях — необязательно
    • Свои кейсы (evals/evals.json, 4–6 реальных запросов с ожидаемыми ответами): тогда полная проверка прогонит именно их, а не черновик от модели.
    • spec.yaml с триггерными фразами и утверждениями — контракт поведения для CI; `skilltest init` создаст шаблон.

    Находки guard · 0

    ✓ Критических и высоких находок нет

    Просканировано файлов: 8. Улики замаскированы. Пометки в серых чипах объясняют, почему серьёзность понижена.

    По спецификации Agent Skills

    ✓ По спецификации Agent Skills замечаний нет

    Процессный рейтинг: все десять параметров 50/100

    • 0Результат и критерий готовности. Не сказано, что считать результатом
    • 0Входы и предусловия. Не сказано, что нужно иметь на входе
    • 20Когда включается. Не сказано, при каком запросе скилл включается
    • 30Повторный запуск. Изменяющих операций: 8, без проверки текущего состояния
    • 50Ошибки и развилки. Развилок: 0, есть раздел про ошибки
    • 60Инструменты и файлы. Используются инструменты (bash, web, python), но во frontmatter они не объявлены
    • 100Шаги. Шагов: 21
    • 100Согласованность. Имя и обязательные поля на месте
    • 100Стоимость исполнения. Тело инструкции 3846 токенов
    • 100Отчётность по ходу. Скилл сообщает о ходе работы
    • low Разделов верхнего уровня: 10. Похоже на несколько доменов в одном скилле

    Всё перечисленное измерено по тексту скилла, а не оценено моделью: цифры проверяемы. Вес параметра тем больше, чем чаще из-за него процесс встаёт.

    Сигналы качества

    • +5В description нет примеров фраз, по которым скилл должен срабатывать
    • +4Описание не говорит, когда скилл НЕ применять (ложные срабатывания)
    • +3Формат ответа не описан: модель каждый раз решает сама
    • +2Инструкции на одном языке
    • +3Длина description 524 символов: достаточно сигнала, не съедает бюджет
    • +4Структура: 17 заголовков
    • +3Пошаговые инструкции: 21 пунктов
    • +4Есть примеры (9 блоков кода)
    • +4Справочные файлы упоминаются в инструкциях (5 из 5)
    • +3Все 2 скриптов описаны в инструкциях
    • +1Лицензия указана

    База качества 70; замечания lint вычитаются, сигналы прибавляют до 100. Итог: 92.

    В песочнице Скрипты не запустились

    Скрипты скилла запущены в одноразовой машине: без сети, с подложными ключами в домашнем каталоге, под наблюдением. Мы записали, что они делали. Попытка выйти в сеть или прочитать чужие секреты ограничивает техническую оценку буквой C; тихий запуск баллов не добавляет.

    Запущено 2 скрипта; каждому дали двадцать секунд, поддельный домашний каталог с ключами и сеть, в которой ничего нет.

    Ни один не дошёл до работы — им не хватило зависимостей, аргументов или файлов. Это не отзыв о поведении: наблюдать было не за чем.

    scripts/profiler_to_waypoint.pyне запустился: profiler_to_waypoint.py: error: the following arguments are required: --input, --format, --output
    scripts/vocab_coverage.pyне запустился: ModuleNotFoundError: No module named 'pandas'

    5 окт. 2026 г.