CD ligandmpnn
Инверсное сворачивание каркаса с учетом лиганда, нуклеиновой кислоты и металла с помощью LigandMPNN (Dauparas et al. 2023, github.com/dauparas/LigandMPNN). Используйте этот навык для перепроектирования остатков, выстилающих связывающий карман вокруг связанной малой молекулы или кофактора, для проектирования металл-координирующих участков, где необходимо соблюдать геометрию, или для получения PDB с разработанной последовательностью из любого запуска MPNN.
машинный переводПоказать оригиналСкрыть оригинал«Inverse-fold a backbone with ligand, nucleic-acid, and metal context u…»
Inverse-fold a backbone with ligand, nucleic-acid, and metal context using LigandMPNN (Dauparas et al. 2023, github.com/dauparas/LigandMPNN). Reach for this skill to redesign the residues lining a binding pocket around a bound small molecule or cofactor, to design metal-coordinating sites where the geometry must be respected, or to get threaded designed-sequence PDBs out of any MPNN run.
Инверсное сворачивание каркаса с учетом лиганда, нуклеиновой кислоты и металла с помощью LigandMPNN (Dauparas et al.
Как процесс D 39/100 · Процесс не доведён — слабые места: шаги, результат и критерий готовности, входы и предусловия
Как улучшить
- Скажите в description, КОГДА применять скилл («используй, когда…», примеры запросов): это главный сигнал для агента.
- Свои кейсы (evals/evals.json, 4–6 реальных запросов с ожидаемыми ответами): тогда полная проверка прогонит именно их, а не черновик от модели.
- spec.yaml с триггерными фразами и утверждениями — контракт поведения для CI; `skilltest init` создаст шаблон.
Находки guard · 0
✓ Критических и высоких находок нет
Просканировано файлов: 1. Улики замаскированы. Пометки в серых чипах объясняют, почему серьёзность понижена.
По спецификации Agent Skills
- предупреждение
description-no-whendescription не говорит, КОГДА применять скилл (нет "use when / используй когда")
Процессный рейтинг: все десять параметров 39/100
- 0Шаги. Инструкция сплошным текстом, шаги не выделены
- 0Результат и критерий готовности. Не сказано, что считать результатом
- 0Входы и предусловия. Не сказано, что нужно иметь на входе
- 0Отчётность по ходу. Скилл ничего не сообщает по ходу работы
- 30Повторный запуск. Изменяющих операций: 2, без проверки текущего состояния
- 50Ошибки и развилки. Развилок: 0, есть раздел про ошибки
- 60Инструменты и файлы. Используются инструменты (bash, web, python), но во frontmatter они не объявлены
- 70Когда включается. Сказано, когда применять, но не сказано, когда не стоит
- 100Согласованность. Имя и обязательные поля на месте
- 100Стоимость исполнения. Тело инструкции 1502 токенов
- low Ответ описан самодельной разметкой (3 тегов): типизированный вызов надёжнее
Всё перечисленное измерено по тексту скилла, а не оценено моделью: цифры проверяемы. Вес параметра тем больше, чем чаще из-за него процесс встаёт.
Сигналы качества
- +5В description нет примеров фраз, по которым скилл должен срабатывать
- +4Описание не говорит, когда скилл НЕ применять (ложные срабатывания)
- +3Нет пошаговых инструкций или чек-листа
- +3Формат ответа не описан: модель каждый раз решает сама
- +2Инструкции на одном языке
- +3Длина description 390 символов: достаточно сигнала, не съедает бюджет
- +4Структура: 7 заголовков
- +4Есть примеры (1 блоков кода)
- +1Лицензия указана
База качества 70; замечания lint вычитаются, сигналы прибавляют до 100. Итог: 70.