SKILLEMALL.ai
GitHub ↗ EN Войти

BD scvi-tools

Вероятностная одноклеточная РНК-сек с помощью scvi-tools — scVI для латентного пространства с коррекцией пакетов, scANVI для полуавтоматического переноса меток и байесовского дифференциального выражения. Обращайтесь к этому навыку для интеграции пакетов scRNA-seq, встраивания клеток для кластеризации, переноса аннотаций из эталона в запрос или оценки дифференциально экспрессируемых генов для каждого кластера. Для пространственной деконволюции / картирования вместо этого используйте методы cell2location, DestVI или Tangram.

машинный переводПоказать оригиналСкрыть оригинал«Probabilistic single-cell RNA-seq with scvi-tools — scVI for a batch-c…»

Probabilistic single-cell RNA-seq with scvi-tools — scVI for a batch-corrected latent space, scANVI for semi-supervised label transfer, and Bayesian differential expression. Reach for this skill to integrate scRNA-seq batches, embed cells for clustering, transfer annotations from a reference onto a query, or score differentially expressed genes per cluster. For spatial deconvolution / mapping use the cell2location, DestVI, or Tangram methods instead.

aipoch/open-science Agent Skills автор: aipoch Apache-2.0 3 файла · 2 скрипта тело ≈ 3 482 токенов Открыть источникgithub.com↗ проанализирован 2 дн назад

Вероятностная одноклеточная РНК-сек с помощью scvi-tools — scVI для латентного пространства с коррекцией пакетов, scANVI для полуавтоматического переноса…

Как процесс D 49/100 · Процесс не доведён — слабые места: шаги, когда включается, входы и предусловия

ИнтеграцияИнфраструктураИИ и агентыТексты и документытип и темы размечены автоматически по тексту скилла
Запускается в: Claude / Claude Code ChatGPT / Codex Gemini CLI Cursor GitHub Copilot / VS Code Qwen Code Kimi Code CLI Z.ai (GLM) DeepSeek (Deep Code) Mistral Vibe LangChain (deepagents) OpenClaw Goose OpenCode
JSON
Технический рейтинг
B
91/100
безопасность, качество, тесты
Безопасность 60%
95
Качество 40%
84
Прогон на моделях
не было
Процессный рейтинг
D
49/100
Процесс не доведён
Шаги вес 15
0
Входы и предусловия вес 11
0
Когда включается вес 12
20
три самых слабых из десяти параметров · все десять

Чем это грозит

Находки средней серьёзности: скорее всего скилл честный, но прочитайте, что именно насторожило сканер.

Опасные команды средняя серьёзность

Ниже описан худший случай для этой категории. Здесь находка средней серьёзности: guard увидел признак, но не доказательство.

Если установить

Скилл содержит команды, которые удаляют файлы, переписывают диски или исполняют код, скачанный из сети. Агент может выполнить их без вопроса, если считает, что так требует инструкция.

Автору

Замените разрушительные команды на безопасные аналоги с подтверждением, ограничьте область действия конкретной папкой и не тяните код через curl | bash: укажите версию и контрольную сумму.

Как улучшить

    Для прогона на моделях — необязательно
    • Свои кейсы (evals/evals.json, 4–6 реальных запросов с ожидаемыми ответами): тогда полная проверка прогонит именно их, а не черновик от модели.
    • spec.yaml с триггерными фразами и утверждениями — контракт поведения для CI; `skilltest init` создаст шаблон.

    Находки guard · 1

    ✓ Критических и высоких находок нет

    Средние и низкие: 1
    • средняя Опасные команды cmd-eval-dynamic SKILL.md:36
      Динамическое выполнение кода из декодированного/недоверенного ввода
      exec(open("scvi-tools/kernel.py", encoding="utf-8").read())   # path to this skill's kernel.py

    Просканировано файлов: 3. Улики замаскированы. Пометки в серых чипах объясняют, почему серьёзность понижена.

    По спецификации Agent Skills

    • заметка frontmatter-key неизвестное поле фронтматтера "requirements"
    • заметка edit-residue в тексте есть пометки об устаревшем (строки 80): проверьте, не остались ли старые правила рядом с новыми — полная проверка читает текст на противоречия

    Процессный рейтинг: все десять параметров 49/100

    • 0Шаги. Инструкция сплошным текстом, шаги не выделены
    • 0Входы и предусловия. Не сказано, что нужно иметь на входе
    • 20Когда включается. Не сказано, при каком запросе скилл включается
    • 30Повторный запуск. Изменяющих операций: 4, без проверки текущего состояния
    • 60Инструменты и файлы. Используются инструменты (bash, python), но во frontmatter они не объявлены
    • 60Результат и критерий готовности. Формат результата описан, критерия завершения нет
    • 100Ошибки и развилки. Развилок: 1, есть раздел про ошибки
    • 100Согласованность. Имя и обязательные поля на месте
    • 100Стоимость исполнения. Тело инструкции 3482 токенов
    • 100Отчётность по ходу. Скилл сообщает о ходе работы

    Всё перечисленное измерено по тексту скилла, а не оценено моделью: цифры проверяемы. Вес параметра тем больше, чем чаще из-за него процесс встаёт.

    Сигналы качества

    • +5В description нет примеров фраз, по которым скилл должен срабатывать
    • +4Описание не говорит, когда скилл НЕ применять (ложные срабатывания)
    • +3Нет пошаговых инструкций или чек-листа
    • +2Инструкции на одном языке
    • +3Длина description 454 символов: достаточно сигнала, не съедает бюджет
    • +4Структура: 10 заголовков
    • +3Формат ответа описан явно
    • +4Есть примеры (6 блоков кода)
    • +1Лицензия указана

    База качества 70; замечания lint вычитаются, сигналы прибавляют до 100. Итог: 84.