BD bioinformatics-analysis
Стандартизированный процесс биоинформатического анализа. Активируется, когда пользователь ставит следующие задачи: (1) анализ данных секвенирования (RNA-seq, ChIP-seq, WGS и т. д.), (2) анализ дифференциальной экспрессии, (3) анализ путей/обогащения, (4) визуализация омиксных данных, (5) статистические тесты, (6) любой аналитический запрос, требующий вызова зрелых биоинформатических инструментов, а не написания кода на Python/R. Основной принцип: приоритет вызова инструментов, запись процесса выполнения shell-скриптов, результаты в виде статистической визуализации Rmarkdown, обеспечение воспроизводимости анализа.
машинный переводПоказать оригиналСкрыть оригинал«标准化生物信息学分析流程。当用户提出以下任务时激活：(1) 测序数据分析（RNA-seq、ChIP-seq、WGS等），(2) 差异表达分析…»
标准化生物信息学分析流程。当用户提出以下任务时激活：(1) 测序数据分析（RNA-seq、ChIP-seq、WGS等），(2) 差异表达分析，(3) 通路/富集分析，(4) 组学数据可视化，(5) 统计检验，(6) 任何需要调用成熟生信工具而非编写Python/R算法代码的分析任务。核心原则：优先调用工具，记录shell脚本过程，结果用Rmarkdown统计可视化，确保分析可重复。
Стандартизированный процесс биоинформатического анализа.
Как процесс D 41/100 · Процесс не доведён — слабые места: результат и критерий готовности, когда включается, входы и предусловия
Как улучшить
- Скажите в description, КОГДА применять скилл («используй, когда…», примеры запросов): это главный сигнал для агента.
- Свои кейсы (evals/evals.json, 4–6 реальных запросов с ожидаемыми ответами): тогда полная проверка прогонит именно их, а не черновик от модели.
- spec.yaml с триггерными фразами и утверждениями — контракт поведения для CI; `skilltest init` создаст шаблон.
Находки guard · 0
✓ Критических и высоких находок нет
Просканировано файлов: 5. Улики замаскированы. Пометки в серых чипах объясняют, почему серьёзность понижена.
По спецификации Agent Skills
- предупреждение
description-no-whendescription не говорит, КОГДА применять скилл (нет "use when / используй когда")
Процессный рейтинг: все десять параметров 41/100
- 0Результат и критерий готовности. Не сказано, что считать результатом
- 0Входы и предусловия. Не сказано, что нужно иметь на входе
- 0Ошибки и развилки. Линейный процесс без обработки сбоев
- 0Отчётность по ходу. Скилл ничего не сообщает по ходу работы
- 20Когда включается. Не сказано, при каком запросе скилл включается
- 40Согласованность. Имя во frontmatter (bioinformatics-analysis) не совпадает с папкой (bioinfo-style)
- 60Инструменты и файлы. Используются инструменты (bash), но во frontmatter они не объявлены
- 100Шаги. Шагов: 12
- 100Стоимость исполнения. Тело инструкции 883 токенов
- 100Повторный запуск. Изменяющих операций нет
Всё перечисленное измерено по тексту скилла, а не оценено моделью: цифры проверяемы. Вес параметра тем больше, чем чаще из-за него процесс встаёт.
Сигналы качества
- +5В description нет примеров фраз, по которым скилл должен срабатывать
- +4Описание не говорит, когда скилл НЕ применять (ложные срабатывания)
- +3Формат ответа не описан: модель каждый раз решает сама
- -31 из 1 скриптов не упомянуты в SKILL.md
- +1Лицензия не указана
- +2Инструкции на одном языке
- +3Длина description 192 символов: достаточно сигнала, не съедает бюджет
- +4Структура: 15 заголовков
- +3Пошаговые инструкции: 12 пунктов
- +4Есть примеры (10 блоков кода)
- +4Справочные файлы упоминаются в инструкциях (2 из 2)
База качества 70; замечания lint вычитаются, сигналы прибавляют до 100. Итог: 73.