AC gromacs-skills
Справочник команд для программного обеспечения молекулярной динамики GROMACS. Вызывается, когда агенту необходимо выполнить команду GROMACS, но он не уверен в ее использовании. Функции охватывают: (1) Обработка топологии и структуры — pdb2gmx, editconf, solvate, insert-molecules, genrestr; (2) Настройка и запуск симуляции — grompp, mdrun; (3) Обработка траектории — trjconv (коррекция PBC, преобразование формата), trjcat (склеивание траекторий); (4) Анализ энергии — energy, enconv, bar; (5) Анализ траектории — rms, rmsf, gyrate, hbond, distance, angle, dihedral, sasa, cluster, mindist; (6) Анализ структуры — covar, anaeig (PCA), mdmat, sham (FEL); (7) Индексация и выбор — make_ndx, select, genion; (8) Инструменты — xpm2ps, check, wham. Подчеркивается приоритетное использование gmx <command> -h для просмотра локальной справки.
машинный переводПоказать оригиналСкрыть оригинал«GROMACS 分子动力学模拟软件命令参考。当 Agent 需要执行 GROMACS 命令但不清楚用法时调用。功能覆盖:(1) 拓扑与结构处…»
GROMACS 分子动力学模拟软件命令参考。当 Agent 需要执行 GROMACS 命令但不清楚用法时调用。功能覆盖:(1) 拓扑与结构处理 - pdb2gmx、editconf、solvate、insert-molecules、genrestr;(2) 模拟设置与运行 - grompp、mdrun;(3) 轨迹处理 - trjconv(PBC修正、格式转换)、trjcat(轨迹拼接);(4) 能量分析 - energy、eneconv、bar;(5) 轨迹分析 - rms、rmsf、gyrate、hbond、distance、angle、dihedral、sasa、cluster、mindist;(6) 结构分析 - covar、anaeig(PCA)、mdmat、sham(FEL);(7) 索引与选择 - make_ndx、select、genion;(8) 工具 - xpm2ps、check、wham。强调优先使用 gmx <command> -h 查看本地帮助。
Справочник команд для программного обеспечения молекулярной динамики GROMACS.
Как процесс C 55/100 · Есть пробелы — слабые места: результат и критерий готовности, когда включается, входы и предусловия
Как улучшить
- Скажите в description, КОГДА применять скилл («используй, когда…», примеры запросов): это главный сигнал для агента.
- Свои кейсы (evals/evals.json, 4–6 реальных запросов с ожидаемыми ответами): тогда полная проверка прогонит именно их, а не черновик от модели.
- spec.yaml с триггерными фразами и утверждениями — контракт поведения для CI; `skilltest init` создаст шаблон.
Находки guard · 0
✓ Критических и высоких находок нет
Просканировано файлов: 4. Улики замаскированы. Пометки в серых чипах объясняют, почему серьёзность понижена.
По спецификации Agent Skills
- предупреждение
description-no-whendescription не говорит, КОГДА применять скилл (нет "use when / используй когда")
Процессный рейтинг: все десять параметров 55/100
- 0Результат и критерий готовности. Не сказано, что считать результатом
- 0Входы и предусловия. Не сказано, что нужно иметь на входе
- 0Ошибки и развилки. Линейный процесс без обработки сбоев
- 20Когда включается. Не сказано, при каком запросе скилл включается
- 100Инструменты и файлы. Внешние инструменты не нужны
- 100Шаги. Шагов: 27
- 100Согласованность. Имя и обязательные поля на месте
- 100Стоимость исполнения. Тело инструкции 1179 токенов
- 100Повторный запуск. Изменяющих операций нет
- 100Отчётность по ходу. Скилл сообщает о ходе работы
- low Разделов верхнего уровня: 13. Похоже на несколько доменов в одном скилле
Всё перечисленное измерено по тексту скилла, а не оценено моделью: цифры проверяемы. Вес параметра тем больше, чем чаще из-за него процесс встаёт.
Сигналы качества
- +5В description нет примеров фраз, по которым скилл должен срабатывать
- +4Описание не говорит, когда скилл НЕ применять (ложные срабатывания)
- +3Формат ответа не описан: модель каждый раз решает сама
- +1Лицензия не указана
- +2Инструкции на одном языке
- +3Длина description 442 символов: достаточно сигнала, не съедает бюджет
- +4Структура: 24 заголовков
- +3Пошаговые инструкции: 27 пунктов
- +4Есть примеры (9 блоков кода)
- +4Справочные файлы упоминаются в инструкциях (2 из 2)
База качества 70; замечания lint вычитаются, сигналы прибавляют до 100. Итог: 76.