BF singlecell-qc
Используйте при разработке, проверке или внедрении контроля качества одноклеточной РНК-секвенирования (scRNA-seq) на Python или R с участием человека и на основе данных. Триггер для метрик scRNA QC, диагностики по образцам, обсуждения пороговых значений, оценки митохондриальных/окружающих/двойных клеток, сравнения MAD с фиксированными порогами или рефакторинга автоматического контроля качества слиянием. Аналитик подтверждает ключевые решения на каждом этапе — агенты должны проверять данные, предлагать варианты и ждать одобрения перед фильтрацией, удалением двойных клеток или слиянием. Не является готовым конвейером.
машинный переводПоказать оригиналСкрыть оригинал«Use when designing, reviewing, or implementing single-cell RNA-seq QC…»
Use when designing, reviewing, or implementing single-cell RNA-seq QC in Python or R with a human-in-the-loop, data-driven approach. Trigger for scRNA QC metrics, per-sample diagnosis, threshold discussion, mitochondrial/ambient/doublet assessment, MAD vs fixed cutoffs, or refactoring automated merge-first QC. The analyst confirms key decisions at each step—agents must inspect data, propose options, and wait for approval before filtering, doublet removal, or merging. Not a turnkey pipeline skill.
Используйте при разработке, проверке или внедрении контроля качества одноклеточной РНК-секвенирования (scRNA-seq) на Python или R с участием человека и на…
Как процесс F 33/100 · Процесс не описан — Скилл ссылается на файлы, которых нет в архиве: assets/gene_sets/*
Как улучшить
- В тексте есть ссылки на отсутствующие файлы: добавьте файлы или уберите ссылки.
- Свои кейсы (evals/evals.json, 4–6 реальных запросов с ожидаемыми ответами): тогда полная проверка прогонит именно их, а не черновик от модели.
- spec.yaml с триггерными фразами и утверждениями — контракт поведения для CI; `skilltest init` создаст шаблон.
Находки guard · 0
✓ Критических и высоких находок нет
Просканировано файлов: 13. Улики замаскированы. Пометки в серых чипах объясняют, почему серьёзность понижена.
По спецификации Agent Skills
- предупреждение
missing-refссылка на отсутствующий файл: assets/gene_sets/* - заметка
edit-residueв тексте есть пометки об устаревшем (строки 142, 159): проверьте, не остались ли старые правила рядом с новыми — полная проверка читает текст на противоречия
Процессный рейтинг: все десять параметров 33/100
- 0Инструменты и файлы. Не хватает 1 файла(ов): assets/gene_sets/*
- 0Результат и критерий готовности. Не сказано, что считать результатом
- 0Входы и предусловия. Не сказано, что нужно иметь на входе
- 0Ошибки и развилки. Линейный процесс без обработки сбоев
- 0Отчётность по ходу. Скилл ничего не сообщает по ходу работы
- 20Когда включается. Не сказано, при каком запросе скилл включается
- 30Повторный запуск. Изменяющих операций: 1, без проверки текущего состояния
- 100Шаги. Шагов: 28
- 100Согласованность. Имя и обязательные поля на месте
- 100Стоимость исполнения. Тело инструкции 1444 токенов
- low Разделов верхнего уровня: 12. Похоже на несколько доменов в одном скилле
Всё перечисленное измерено по тексту скилла, а не оценено моделью: цифры проверяемы. Вес параметра тем больше, чем чаще из-за него процесс встаёт.
Сигналы качества
- +5В description нет примеров фраз, по которым скилл должен срабатывать
- +4Описание не говорит, когда скилл НЕ применять (ложные срабатывания)
- +3Формат ответа не описан: модель каждый раз решает сама
- +1Лицензия не указана
- +2Инструкции на одном языке
- +3Длина description 501 символов: достаточно сигнала, не съедает бюджет
- +4Структура: 14 заголовков
- +3Пошаговые инструкции: 28 пунктов
- +4Есть примеры (4 блоков кода)
- +4Справочные файлы упоминаются в инструкциях (6 из 6)
- +3Все 2 скриптов описаны в инструкциях
База качества 70; замечания lint вычитаются, сигналы прибавляют до 100. Итог: 85.