SKILLEMALL.ai

Рейтинг скиллов

887 скиллов. Оценка A–F складывается из безопасности (60%) и качества (40%), тесты дают бонус. Рейтинг пополняется автоматически из открытых каталогов.

887
#ОценкаСкиллБаллы ▾Безоп.КачествоПроцессТестыПопулярностьОбновлён
201B
Проектирование пегРНК для прайм-редактирования с использованием алгоритмов PrimeDesign. Генерация последовательностей спейсера, PBS и матрицы обратной транскриптазы для точных геномных модификаций без
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
202B
Пространственный анализ клеточных окрестностей и взаимодействий в данных IMC. Охватывает графы соседей, пространственную статистику и тестирование взаимодействий. Используйте при анализе пространствен
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
203B
Идентификация неоантигенов опухоли из соматических мутаций с использованием pVACtools для персонализированной противораковой иммунотерапии. Прогнозирование мутантных пептидов, которые связываются с HL
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
204B
Загрузка данных пространственной транскриптомики с платформ Visium, Xenium, MERFISH, Slide-seq и других с использованием Squidpy и SpatialData. Чтение выходных данных Space Ranger, преобразование форм
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
205B
Идентификация пространственных доменов и областей ткани в данных пространственной транскриптомики с использованием Squidpy и Scanpy. Кластеризация точек с учетом экспрессии и пространственного контекс
9310082B—★ 3 04521 июл. 2026 г.
206B
Клиническая интерпретация вариантов с использованием ClinVar, руководств ACMG и предикторов патогенности. Приоритизация вариантов для диагностических и исследовательских приложений. Используйте при ин
9310082D—★ 3 04521 июл. 2026 г.
207B
Построение масштабированных по времени филогений и вывод эволюционной динамики с использованием TreeTime и BEAST2 для анализа вспышек. Оценка времени дивергенции, скоростей молекулярных часов и предко
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
208B
Проектирование направляющих для редактирования цитозина и аденина с использованием оптимизации окна редактирования и прогнозирования результатов BE-Hive. Выбор оптимальных позиций для конверсий C-в-T
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
209B
Проектирование донорных шаблонов для гомологично-направленной репарации для CRISPR-вставок с использованием primer3-py. Создание шаблонов ssODN, dsDNA или плазмид с оптимизированными гомологичными пле
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
210B
Метрики качества для данных IMC, включая отношение сигнал/шум, корреляцию каналов, целостность ткани и контроль качества при сборе данных. Используйте при оценке качества данных перед анализом или при
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
211B
Обработка и анализ изображений тканей из данных пространственной транскриптомики с использованием Squidpy. Извлечение признаков изображения, сегментация клеток/ядер и вычисление морфологических призна
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
212B
Анализ репертуаров BCR на предмет соматических гипермутаций, клональных линий и филогенетики B-клеток с использованием фреймворка Immcantation. Используйте при изучении аффинной созревания B-клеток, д
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
213B
Запрос gnomAD для популяционных частот аллелей для оценки редкости вариантов. Используйте при фильтрации вариантов по популяционной частоте для анализа редких заболеваний или определения того, являетс
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
214B
Извлечение и анализ мутационных сигнатур из соматических вариантов с использованием SigProfiler или MutationalPatterns для характеристики мутагенных процессов. Используйте при идентификации механизмов
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
215B
Анализ данных RNA-seq временных рядов с использованием limma voom со сплайнами, maSigPro и ImpulseDE2. Идентификация генов с динамическими паттернами экспрессии. Используйте при анализе данных экспрес
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
216B
Неконтролируемая кластеризация и идентификация типов клеток для проточной/масс-цитометрии. Охватывает рабочие процессы FlowSOM, Phenograph и CATALYST. Используйте при обнаружении популяций клеток в вы
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
217B
Прогнозирование специфичности TCR-эпитопа с использованием ERGO-II и моделей глубокого обучения для распознавания антигенов Т-клеточным рецептором. Сопоставление TCR с их соответствующими эпитопами ил
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
218B
Обнаружение и коррекция горизонтальной плейотропии в анализах Менделевской рандомизации с использованием MR-PRESSO для удаления выбросов, регрессии MR-Egger для направленной плейотропии и фильтрации S
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
219B
Запрашивает API myvariant.info для получения агрегированных аннотаций вариантов из нескольких баз данных (ClinVar, gnomAD, dbSNP, COSMIC и др.) одним запросом. Используйте при одновременной аннотации
9310082D—★ 3 04521 июл. 2026 г.
220B
Анализирует результаты редактирования оснований и прайм-редактирования, включая эффективность редактирования, побочные редактирования и частоту инделов. Используйте при количественной оценке результат
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
221B
Анализ дифференциальной обильности и состояния для данных цитометрии. Сравнение клеточных популяций между условиями с использованием статистических методов. Используйте при проверке значительных измен
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
222B
Прогнозирует B-клеточные и T-клеточные эпитопы с использованием BepiPred, инструментов IEDB и методов на основе структуры для дизайна вакцин и антител. Определяет иммуногенные участки в антигенах. Исп
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
223B
Вызов вариантов на основе глубокого обучения из длинных прочтений с использованием Clair3 для SNP и коротких инделов. Используйте при вызове зародышевых вариантов из выравниваний ONT или PacBio, особе
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
224B
Анализирует данные PacBio Iso-Seq для обнаружения и количественной оценки полноразмерных изоформ. Используйте при характеристике разнообразия транскриптов или идентификации новых сплайс-вариантов.
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
225B
Анализирует межклеточную коммуникацию, опосредованную метаболитами, с помощью MeboCost для вывода метаболической сигнализации между типами клеток. Прогнозирует секрецию и восприятие метаболитов на осн
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
226B
Находит дифференциально доступные участки хроматина между условиями с использованием DiffBind или DESeq2. Используйте при сравнении доступности хроматина между группами лечения, типами клеток или стад
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
227B
Запрашивает PharmGKB и CPIC для взаимодействия лекарств и генов, фармакогеномных аннотаций и рекомендаций по дозировке. Используйте при прогнозировании реакции на лекарства по генетическим вариантам и
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
228B
Разлагает генетические эффекты на прямые и косвенные пути через опосредующие переменные с использованием пакета R mediation. Проверяет, опосредуют ли экспрессия генов, метилирование или другие молекул
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
229B
Разлагает A/B компартменты из данных Hi-C с использованием cooltools и разложения по собственным векторам. Определяет активные (A) и неактивные (B) компартменты хроматина из матриц контактов. Использу
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
230B
Присвоение типов клеток на основе экспрессии маркеров в данных IMC. Включает ручное гейтирование, кластеризацию и автоматические подходы к классификации. Используйте при присвоении типов клеток сегмен
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
231B
Идентификация метаболитов по m/z и времени удерживания. Включает сопоставление с базами данных, сопоставление спектров MS/MS и присвоение уровня достоверности. Используйте при присвоении идентификатор
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
232B
Анализирует мультимодальные одноклеточные данные (CITE-seq, Multiome, spatial). Используйте при работе с данными, которые измеряют несколько модальностей на клетку, таких как РНК + белок или РНК + ATA
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
233B
Рассчитывает метрики разнообразия иммунного репертуара, сравнивает образцы и отслеживает клональную динамику с помощью VDJtools. Используйте при анализе разнообразия репертуара, поиске общих клонотипо
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
234B
Запрашивает ClinVar для классификации патогенности вариантов, статуса рассмотрения и ассоциаций с заболеваниями через REST API или локальный VCF. Используйте при определении клинической значимости вар
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
235B
Рассчитывает полигенные баллы риска с использованием PRSice-2, LDpred2 или PRS-CS из сводных статистик GWAS. Используйте при прогнозировании риска заболеваний по геномным вариантам.
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
236B
CRISPResso2 для анализа результатов редактирования генов CRISPR. Количественно определяет индели, эффективность HDR и генерирует подробные отчеты о редактировании. Используйте при анализе данных секве
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
237B
Нормализация на основе шариков для CyTOF и высокопараметрической проточной цитометрии. Включает нормализацию EQ-шариков, коррекцию дрейфа сигнала и пакетную нормализацию. Используйте при коррекции дре
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
238B
Предобработка метаболомики на основе MS-DIAL как альтернатива XCMS. Включает обнаружение пиков, выравнивание, аннотацию и экспорт для последующего анализа. Используйте при обработке выходных файлов MS
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
239B
Статистический анализ данных метаболомики. Включает одномерное тестирование, многомерные методы (PCA, PLS-DA) и поиск биомаркеров. Используйте при идентификации дифференциально обильных метаболитов ил
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
240B
Тестирование дифференциальной обильности для данных микробиома с использованием методов, учитывающих композиционную природу, таких как ALDEx2, ANCOM-BC2 и MaAsLin2. Используйте при идентификации таксо
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
241B
Статистическое тестирование дифференциально обильных белков между условиями. Включает рабочие процессы limma и MSstats с коррекцией множественного тестирования. Используйте при идентификации белков со
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
242B
Сопоставление пептид-спектр и идентификация белков из данных MS/MS. Используйте при идентификации пептидов из тандемных масс-спектров. Включает поиск по базе данных, сопоставление спектральных библиот
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
243B
Запрашивает dbSNP для поиска rsID, аннотаций вариантов и перекрестных ссылок на другие базы данных. Используйте при сопоставлении между rsID и геномными координатами или при получении основной информа
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
244B
Обнаружение и удаление дубликатов из данных проточной и масс-цитометрии. Включает FSC/SSC-гейтинг и вычислительные методы обнаружения дубликатов. Используйте для фильтрации клеточных агрегатов перед к
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
245B
Прогнозирование функционального состава метагенома на основе данных маркерного гена 16S рРНК с помощью PICRUSt2. Оценка обилия KEGG, MetaCyc и EC по таблицам ASV. Используйте, когда требуется функцион
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
246B
Визуализация результатов обогащения с помощью функций пакета enrichplot. Используйте для создания изображений, пригодных для публикации, из результатов clusterProfiler. Включает dotplot, barplot, cnet
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
247B
Определение траекторий развития и псевдовремени по данным одноклеточной РНК-секвенирования с использованием Monocle3, Slingshot и scVelo для анализа РНК-скорости. Используйте для определения траектори
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
248B
Анализ одноклеточных данных TCR и BCR, интегрированных с экспрессией генов, с помощью scirpy. Используйте при работе с данными 10x Genomics VDJ наряду с scRNA-seq или при интеграции информации об имму
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
249B
Коррекция пакетных эффектов для CRISPR-скрининга. Включает нормализацию между партиями, обработку технических реплик, анализ с учетом партий. Используйте при объединении скринингов из нескольких парти
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
250B
Визуализация матриц контактов Hi-C, TAD, петель и геномных признаков с использованием matplotlib, cooltools и HiCExplorer. Создание треугольных графиков, виртуального 4C и многодорожечных изображений.
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.

Описания переведены автоматически; оригинал — на странице скилла.