BC protein-qc
Метрики контроля качества и пороговые значения фильтрации для дизайна белков. Используйте этот навык, когда: (1) Оцениваете качество дизайна для связывания, экспрессии или структуры, (2) Устанавливаете пороговые значения фильтрации для pLDDT, ipTM, PAE, (3) Проверяете уязвимости последовательности (цистеины, деамидирование, полибазовые кластеры), (4) Создаете многоступенчатые конвейеры фильтрации, (5) Вычисляете метрики интерфейса PyRosetta (dG, SC, dSASA), (6) Проверяете биофизические свойства (нестабильность, GRAVY, pI), (7) Ранжируете дизайны с помощью составного скоринга. Этот навык предоставляет основанные на исследованиях пороговые значения из конкурсов дизайна связующих веществ и опубликованных эталонов.
машинный переводПоказать оригиналСкрыть оригинал«Quality control metrics and filtering thresholds for protein design. U…»
Quality control metrics and filtering thresholds for protein design. Use this skill when: (1) Evaluating design quality for binding, expression, or structure, (2) Setting filtering thresholds for pLDDT, ipTM, PAE, (3) Checking sequence liabilities (cysteines, deamidation, polybasic clusters), (4) Creating multi-stage filtering pipelines, (5) Computing PyRosetta interface metrics (dG, SC, dSASA), (6) Checking biophysical properties (instability, GRAVY, pI), (7) Ranking designs with composite scoring. This skill provides research-backed thresholds from binder design competitions and published benchmarks.
Метрики контроля качества и пороговые значения фильтрации для дизайна белков.
Как процесс C 58/100 · Есть пробелы — слабые места: результат и критерий готовности, когда включается, входы и предусловия
Как улучшить
- Для Hermes description должен быть одним предложением до 60 символов; условия применения вынесите в раздел «When to Use».
- Свои кейсы (evals/evals.json, 4–6 реальных запросов с ожидаемыми ответами): тогда полная проверка прогонит именно их, а не черновик от модели.
- spec.yaml с триггерными фразами и утверждениями — контракт поведения для CI; `skilltest init` создаст шаблон.
Находки guard · 0
✓ Критических и высоких находок нет
Просканировано файлов: 5. Улики замаскированы. Пометки в серых чипах объясняют, почему серьёзность понижена.
По спецификации Agent Skills
- предупреждение
description-long-hermesdescription 610 символов, а стандарт Hermes требует ≤ 60 (одно предложение, с точкой)
Процессный рейтинг: все десять параметров 58/100
- 0Результат и критерий готовности. Не сказано, что считать результатом
- 0Входы и предусловия. Не сказано, что нужно иметь на входе
- 0Отчётность по ходу. Скилл ничего не сообщает по ходу работы
- 20Когда включается. Не сказано, при каком запросе скилл включается
- 50Ошибки и развилки. Развилок: 0, есть раздел про ошибки
- 100Инструменты и файлы. Внешние инструменты не нужны
- 100Шаги. Шагов: 8
- 100Согласованность. Имя и обязательные поля на месте
- 100Стоимость исполнения. Тело инструкции 2109 токенов
- 100Повторный запуск. Изменяющих операций нет
- low Разделов верхнего уровня: 11. Похоже на несколько доменов в одном скилле
Всё перечисленное измерено по тексту скилла, а не оценено моделью: цифры проверяемы. Вес параметра тем больше, чем чаще из-за него процесс встаёт.
Сигналы качества
- +5В description нет примеров фраз, по которым скилл должен срабатывать
- +4Описание не говорит, когда скилл НЕ применять (ложные срабатывания)
- +3Формат ответа не описан: модель каждый раз решает сама
- +2Инструкции на одном языке
- +3Длина description 609 символов: достаточно сигнала, не съедает бюджет
- +4Структура: 21 заголовков
- +3Пошаговые инструкции: 8 пунктов
- +4Есть примеры (9 блоков кода)
- +4Справочные файлы упоминаются в инструкциях (4 из 4)
- +1Лицензия указана
База качества 70; замечания lint вычитаются, сигналы прибавляют до 100. Итог: 83.