AD pacsomatic
Подготавливает и запускает рабочие процессы PacBio HiFi для геномики Pacsomatic от nf-core для парных образцов опухоль-норма с входными данными BAM без выравнивания. Поддерживает генерацию образцов, закрепленные артефакты запуска Nextflow, локальные проверки, отправку заданий в LSF/Slurm/PBS Pro/SGE и устранение неполадок при запуске. Используйте для подготовки и выполнения запусков pacsomatic, а не для общего анализа соматических данных коротких прочтений или PACS медицинской визуализации.
машинный переводПоказать оригиналСкрыть оригинал«Prepares and launches nf-core/pacsomatic matched tumor-normal PacBio H…»
Prepares and launches nf-core/pacsomatic matched tumor-normal PacBio HiFi genomics workflows from unaligned BAM inputs. Supports samplesheet generation, pinned Nextflow launch artifacts, local checks, LSF/Slurm/PBS Pro/SGE launcher submission, and startup troubleshooting. Use for pacsomatic run preparation and execution, not general short-read somatic analysis or medical imaging PACS.
Подготавливает и запускает рабочие процессы PacBio HiFi для геномики Pacsomatic от nf-core для парных образцов опухоль-норма с входными данными BAM без…
Как процесс D 49/100 · Процесс не доведён — слабые места: результат и критерий готовности, когда включается, входы и предусловия
Как улучшить
- Свои кейсы (evals/evals.json, 4–6 реальных запросов с ожидаемыми ответами): тогда полная проверка прогонит именно их, а не черновик от модели.
- spec.yaml с триггерными фразами и утверждениями — контракт поведения для CI; `skilltest init` создаст шаблон.
Находки guard · 0
✓ Критических и высоких находок нет
Просканировано файлов: 7. Улики замаскированы. Пометки в серых чипах объясняют, почему серьёзность понижена.
По спецификации Agent Skills
✓ По спецификации Agent Skills замечаний нет
Процессный рейтинг: все десять параметров 49/100
- 0Входы и предусловия. Не сказано, что нужно иметь на входе
- 0Ошибки и развилки. Линейный процесс без обработки сбоев
- 0Отчётность по ходу. Скилл ничего не сообщает по ходу работы
- 20Когда включается. Не сказано, при каком запросе скилл включается
- 30Повторный запуск. Изменяющих операций: 3, без проверки текущего состояния
- 40Результат и критерий готовности. Не сказано, что считать результатом
- 60Инструменты и файлы. Используются инструменты (bash), но во frontmatter они не объявлены
- 100Шаги. Шагов: 10
- 100Согласованность. Имя и обязательные поля на месте
- 100Стоимость исполнения. Тело инструкции 1367 токенов
Всё перечисленное измерено по тексту скилла, а не оценено моделью: цифры проверяемы. Вес параметра тем больше, чем чаще из-за него процесс встаёт.
Сигналы качества
- +5В description нет примеров фраз, по которым скилл должен срабатывать
- +4Описание не говорит, когда скилл НЕ применять (ложные срабатывания)
- +3Формат ответа не описан: модель каждый раз решает сама
- +2Инструкции на одном языке
- +3Длина description 387 символов: достаточно сигнала, не съедает бюджет
- +4Структура: 5 заголовков
- +3Пошаговые инструкции: 10 пунктов
- +4Есть примеры (3 блоков кода)
- +4Справочные файлы упоминаются в инструкциях (3 из 3)
- +3Все 1 скриптов описаны в инструкциях
- +1Лицензия указана
База качества 70; замечания lint вычитаются, сигналы прибавляют до 100. Итог: 92.