CC alphagenome-single-variant-analysis
Анализирует влияние генетических вариантов на экспрессию генов (RNA-seq), доступность хроматина (DNASE), метки гистонов (ChIP) и факторы транскрипции с помощью API AlphaGenome. Используйте, когда пользователь спрашивает о влиянии некодирующих вариантов, патогенности, клинической значимости, ассоциациях с заболеваниями, функциональных эффектах, изменениях экспрессии генов, нарушении сплайсинга или регуляторных эффектах в промоторах и энхансерах. Также используйте для сопоставления биологических терминов с онтологиями тканей/клеток (UBERON/CL) или анализа вариантов в формате chr:pos:ref>alt.
машинный переводПоказать оригиналСкрыть оригинал«Analyzes genetic variant effects on gene expression (RNA-seq), chromat…»
Analyzes genetic variant effects on gene expression (RNA-seq), chromatin accessibility (DNASE), histone marks (ChIP), and transcription factors using the AlphaGenome API. Use when the user asks about non-coding variant effects, pathogenicity, clinical significance, disease associations, functional effects, gene expression changes, splicing disruption, or regulatory effects in promoters and enhancers. Also use for resolving biological terms to tissue/cell-type ontologies (UBERON/CL) or analyzing variants in chr:pos:ref>alt format.
Анализирует влияние генетических вариантов на экспрессию генов (RNA-seq), доступность хроматина (DNASE), метки гистонов (ChIP) и факторы транскрипции с…
Как процесс C 58/100 · Есть пробелы — Скилл ссылается на файлы, которых нет в архиве: examples/splicing/, examples/model_limitation_RNU4ATAC/, examples/polyadenylation_HBA2/
Как улучшить
- В тексте есть ссылки на отсутствующие файлы: добавьте файлы или уберите ссылки.
- Свои кейсы (evals/evals.json, 4–6 реальных запросов с ожидаемыми ответами): тогда полная проверка прогонит именно их, а не черновик от модели.
- spec.yaml с триггерными фразами и утверждениями — контракт поведения для CI; `skilltest init` создаст шаблон.
Находки guard · 0
✓ Критических и высоких находок нет
Просканировано файлов: 25. Улики замаскированы. Пометки в серых чипах объясняют, почему серьёзность понижена.
По спецификации Agent Skills
- предупреждение
missing-refссылка на отсутствующий файл: examples/splicing/ - предупреждение
missing-refссылка на отсутствующий файл: examples/model_limitation_RNU4ATAC/ - предупреждение
missing-refссылка на отсутствующий файл: examples/polyadenylation_HBA2/ - предупреждение
missing-refссылка на отсутствующий файл: examples/regulatory/ - предупреждение
missing-refссылка на отсутствующий файл: examples/negative_result_GATA4/ - предупреждение
missing-refссылка на отсутствующий файл: examples/negative_result_TGFB3/
Процессный рейтинг: все десять параметров 58/100
- 0Инструменты и файлы. Не хватает 6 файла(ов): examples/splicing/, examples/model_limitation_RNU4ATAC/, examples/polyadenylation_HBA2/
- 0Результат и критерий готовности. Не сказано, что считать результатом
- 0Отчётность по ходу. Скилл ничего не сообщает по ходу работы
- 40Согласованность. Имя во frontmatter (alphagenome-single-variant-analysis) не совпадает с папкой (alphagenome_single_variant_analysis)
- 70Входы и предусловия. Входные данные и предусловия перечислены
- 100Шаги. Шагов: 34
- 100Когда включается. Сказано, когда применять и когда не применять
- 100Ошибки и развилки. Развилок: 2, есть раздел про ошибки
- 100Стоимость исполнения. Тело инструкции 2833 токенов
- 100Повторный запуск. Изменяющие операции проверяют текущее состояние
- medium Правила безопасности и запреты внутри скилла: их место в системном промпте, здесь они не защищают
Всё перечисленное измерено по тексту скилла, а не оценено моделью: цифры проверяемы. Вес параметра тем больше, чем чаще из-за него процесс встаёт.
Сигналы качества
- +5В description нет примеров фраз, по которым скилл должен срабатывать
- +4Описание не говорит, когда скилл НЕ применять (ложные срабатывания)
- +3Формат ответа не описан: модель каждый раз решает сама
- -34 из 7 скриптов не упомянуты в SKILL.md
- +1Лицензия не указана
- +2Инструкции на одном языке
- +3Длина description 535 символов: достаточно сигнала, не съедает бюджет
- +4Структура: 13 заголовков
- +3Пошаговые инструкции: 34 пунктов
- +4Есть примеры (6 блоков кода)
- +4Справочные файлы упоминаются в инструкциях (3 из 3)
База качества 70; замечания lint вычитаются, сигналы прибавляют до 100. Итог: 73.