SKILLEMALL.ai

Рейтинг скиллов

40 скиллов. Оценка A–F складывается из безопасности (60%) и качества (40%), тесты дают бонус. Рейтинг пополняется автоматически из открытых каталогов.

40
#ОценкаСкиллБаллы ▾Безоп.КачествоПроцессТестыПопулярностьОбновлён
1A
Восстановление, атрибуция, датировка, контекстуализация и встраивание древних текстов с помощью Aeneas (латынь) / Ithaca (древнегреческий). Используйте, когда вас просят «восстановить», «атрибутироват
9910097B——2 ч назад
2A
Используйте, когда вы хотите получить полуколичественные данные об экспрессии белков и их пространственной локализации из Атласа белков человека (HPA).
9810095C——2 ч назад
3A
Запрос к ClinicalTrials.gov через APIv2. Используйте, когда вы хотите искать исследования по состоянию, препарату, местоположению, статусу или фазе; получать детали исследования по NCT ID; проверять к
9810094C——2 ч назад
4A
Запрос к REST API QuickGO и Evidence & Conclusion Ontology (ECO). Используйте это, когда вам нужно сопоставить гены с биологическими процессами, молекулярными функциями или клеточными компонентами, на
9810095C——2 ч назад
5A
Запрос к базе данных ChEMBL для биоактивных молекул, лекарственных мишеней, данных биоактивности, одобренных лекарств и химических структур. Используйте, когда пользователь спрашивает о соединениях, м
9810094B——2 ч назад
6A
Преобразует завершенный рабочий процесс или взаимодействие пользователя в многоразовый навык агента. Используйте, когда пользователь просит превратить свой рабочий процесс, взаимодействие или многошаг
9710093C——2 ч назад
7A
Визуализация, анализ и рендеринг белковых и молекулярных структур с помощью PyMOL. Используйте, когда пользователь хочет создавать изображения белковых структур, выполнять структурное выравнивание или
9710092B——2 ч назад
8A
Получение и анализ предсказанных структур AlphaFold для белка. Используйте, когда пользователь предоставляет конкретный идентификатор доступа UniProt и хочет получить метрики уверенности структуры (pL
9610091B——2 ч назад
9A
Поиск гомологичных белковых последовательностей с помощью MMseqs2 (быстрый, по умолчанию) или BLAST (полный, резервный). Активируйте это всякий раз, когда пользователь предоставляет белковую последова
9610091B——2 ч назад
10A
Создает глубокие ссылки и URL-адреса для веб-сайта AlphaGenome Atlas. Поддерживает создание ссылок для исследования отдельных вариантов (1-based chr:pos:ref>alt), просмотров геномных локусов (1-based
9610090B——2 ч назад
11A
Запрос к научной базе данных OpenAlex для поиска исследовательских работ, авторов, учреждений, тем, источников, издателей, спонсоров, географических местоположений и ключевых слов. Используйте при пои
9610091C——2 ч назад
12A
Поиск научных статей, препринтов и публикаций на arXiv. Извлечение метаданных, аннотаций и загрузка полных текстов в формате PDF или HTML. Используйте, когда пользователь просит найти исследовательски
9610091C——2 ч назад
13A
Запрос к Реестру регуляторных элементов cis (cCRE) ENCODE через API SCREEN GraphQL или выполнение пользовательских запросов к API Portal ENCODE REST для экспериментов и файлов (пики ChIP-seq и т. д.).
969991C——2 ч назад
14A
Выполняет множественное выравнивание белковых последовательностей с помощью EBI Clustal Omega. Используйте, когда вам нужно выровнять несколько последовательностей для оценки сходства, сохранения доме
9610091C——2 ч назад
15A
Получение белковых и нуклеотидных последовательностей из баз данных NCBI с помощью E-utilities. Поддерживает прямой поиск по идентификатору доступа, трансляцию кодирующих последовательностей ДНК (CDS)
9610090C——2 ч назад
16A
Запрос к базе данных Reactome (Сервисы анализа и контента). Используйте, когда пользователь спрашивает об анализе путей, обогащении списка генов, получении результатов по токену, поиске некартированны
9610091C——2 ч назад
17A
Используйте, когда вам нужна клиническая значимость, классификация патогенности (например, патогенный, доброкачественный, VUS), обоснование клинических доказательств или поиск эталонных контролей «стр
9610091C——2 ч назад
18A
Запрос к базе данных Ensembl для разрешения идентификаторов генов, транскриптов и белков, получения геномных или белковых последовательностей, извлечения структур генов (экзонов) и получения предсказа
9610091C——2 ч назад
19A
Запрос, поиск и загрузка данных из API openFDA для лекарств, устройств, пищевых продуктов, табака, косметики, ветеринарных препаратов, веществ и данных о прозрачности. Используйте для данных о нежелат
9610091C——2 ч назад
20A
Запрос к PubChem, поиск по названию/CID/SMILES, получение свойств, поиск по сходству/подструктуре, биоактивность для хемоинформатики. Используйте, когда пользователь спрашивает о конкретном химическом
9610091C——2 ч назад
21A
Запросы к базе данных UniBind для экспериментально подтвержденных сайтов связывания транскрипционных факторов (TF). Используйте при получении прямых наборов данных о взаимодействии TF-ДНК, загрузке ко
9610091C——2 ч назад
22A
Запрос к базе данных Genome Aggregation Database (gnomAD). Используйте при определении редкости или частоты аллелей конкретных генетических вариантов, получении метрик ограничения генов (pLI, LOEUF) д
9610091C——2 ч назад
23A
Запрос к базе данных JASPAR для профилей связывания транскрипционных факторов (TF). Используйте при получении матриц частоты позиций (PFM) или матриц веса позиций (PWM) для конкретных TF, разрешении с
9610090C——2 ч назад
24A
Запрос к базе данных STRING для взаимодействий белок-белок (PPI), функционального обогащения и гомологии. Используйте, когда пользователь спрашивает о взаимодействиях между конкретными белками, доказа
9610091C——2 ч назад
25A
Используйте, когда вы хотите получить количественные данные об экспрессии РНК и информацию о вариантах eQTL из проекта GTEx (Genotype-Tissue Expression) в 54 неповрежденных тканевых участках.
9610091C——2 ч назад
26A
Выполняет 3D-структурный поиск белков по различным базам данных (PDB, AlphaFold, CATH, MGnify и др.) с использованием API Foldseek. Используйте ТОЛЬКО когда пользователь предоставляет файл с 3D-коорди
9510087B——2 ч назад
27A
Получает оценки эволюционной консервативности (phyloP, phastCons) и сайты связывания транскрипционных факторов (TFBS) из UCSC Genome Browser. Используйте при анализе того, являются ли геномные вариант
9510087D——2 ч назад
28A
Используйте, когда вы хотите найти, сопоставить и выполнить поиск коротких генетических вариантов (SNP, индели) в базе данных dbSNP от NCBI. Разрешает между rsID, геномными координатами в формате VCF
9510087C——2 ч назад
29A
Используйте, когда вы хотите найти или скачать экспериментально определенные 3D-структуры биомолекул (белков, нуклеиновых кислот, связанных лигандов). Поддерживает поиск по сходству последовательносте
9510087D——2 ч назад
30B
Запрашивает и ищет в службе поиска по онтологиям EMBL-EBI (OLS) термины, определения и иерархии биомедицинских онтологий в более чем 250 онтологиях (например, GO, DOID, HP). Используйте, когда пользов
9410085C——2 ч назад
31B
Ищет научную литературу в PubMed, включая опубликованные клинические испытания. Получает аннотации и полные тексты. Связывает опубликованные исследования с биологическими базами данных (гены, белки, н
9210079C——2 ч назад
32B
Ищите научную литературу в Europe PMC и скачивайте полнотекстовые статьи в формате Open Access и PDF. Получайте полнотекстовые XML/текстовые файлы по PMCID, списки цитирований и библиографию.
9010075C——2 ч назад
33B
Просматривайте, фильтруйте и скачивайте препринты по наукам о жизни, биологии и медицине с bioRxiv и medRxiv. Поддерживает получение метаданных статей по DOI и просмотр по диапазону дат с фильтрами по
9010075C——2 ч назад
34C
Проверяет, установлен ли менеджер пакетов Python uv, и устанавливает его, если он отсутствует. Гарантирует, что uv находится в PATH. Используйте, когда другой навык требует uv в качестве предварительн
899876D——2 ч назад
35C
Инструкции по безопасной работе с API-ключами и учетными данными, проверке их наличия и запросу у пользователя на их добавление в случае отсутствия с использованием безопасного протокола.
889972C——2 ч назад
36A
Доступ к метаданным белков, их функциям, таксономии и последовательностям из UniProtKB, UniParc и UniRef. Используйте при поиске белков, сопоставлении идентификаторов или получении функциональных анно
9610089F не хватает файлов——2 ч назад
37B
Идентифицирует домены, семейства и сайты в белках; находит все белки в семействе или имеющие общий домен; исследует распределение видов для домена; аннотирует геномы семействами белков и GO-терминами.
919585D не хватает файлов——2 ч назад
38C
Анализирует влияние генетических вариантов на экспрессию генов (RNA-seq), доступность хроматина (DNASE), метки гистонов (ChIP) и факторы транскрипции с помощью API AlphaGenome. Используйте, когда поль
8910073C не хватает файлов——2 ч назад
39C
Оценивает, аннотирует и анализирует функциональное воздействие генетических вариантов с помощью оценок AlphaGenome Variant Impact (AVI). Запрашивает варианты в формате chr:pos:ref>alt, аннотирует набо
8910072D не хватает файлов——2 ч назад
40C
Запрашивает платформу Open Targets для ассоциаций мишеней с заболеваниями, поиска лекарственных мишеней, данных о достижимости/безопасности, генетических/омиксных доказательств, известных лекарств для
8910073D не хватает файлов——2 ч назад

Описания переведены автоматически; оригинал — на странице скилла.