CD alphagenome-variant-impact-score
Оценивает, аннотирует и анализирует функциональное воздействие генетических вариантов с помощью оценок AlphaGenome Variant Impact (AVI). Запрашивает варианты в формате chr:pos:ref>alt, аннотирует наборы данных VCF/табличные, выполняет сканирование окон сатурационного мутагенеза (1-based closed chr:start-end) и извлекает координаты генов/экзонов/переходов GENCODE v46 GTF все через API AlphaGenome Atlas.
машинный переводПоказать оригиналСкрыть оригинал«Score, annotate, and analyze the functional impact of genetic variants…»
Score, annotate, and analyze the functional impact of genetic variants using AlphaGenome Variant Impact (AVI) scores. Query variants in chr:pos:ref>alt format, annotate VCF/tabular callsets, perform saturation mutagenesis window scans (1-based closed chr:start-end), and extract GENCODE v46 GTF gene/exon/junction coordinates all via the AlphaGenome Atlas API.
Оценивает, аннотирует и анализирует функциональное воздействие генетических вариантов с помощью оценок AlphaGenome Variant Impact (AVI).
Как процесс D 42/100 · Процесс не доведён — Скилл ссылается на файлы, которых нет в архиве: scripts/alphagenome_atlas_links.py
Как улучшить
- Скажите в description, КОГДА применять скилл («используй, когда…», примеры запросов): это главный сигнал для агента.
- В тексте есть ссылки на отсутствующие файлы: добавьте файлы или уберите ссылки.
- Свои кейсы (evals/evals.json, 4–6 реальных запросов с ожидаемыми ответами): тогда полная проверка прогонит именно их, а не черновик от модели.
- spec.yaml с триггерными фразами и утверждениями — контракт поведения для CI; `skilltest init` создаст шаблон.
Находки guard · 0
✓ Критических и высоких находок нет
Просканировано файлов: 3. Улики замаскированы. Пометки в серых чипах объясняют, почему серьёзность понижена.
По спецификации Agent Skills
- предупреждение
description-no-whendescription не говорит, КОГДА применять скилл (нет "use when / используй когда") - предупреждение
missing-refссылка на отсутствующий файл: scripts/alphagenome_atlas_links.py
Процессный рейтинг: все десять параметров 42/100
- 0Инструменты и файлы. Не хватает 1 файла(ов): scripts/alphagenome_atlas_links.py
- 0Ошибки и развилки. Линейный процесс без обработки сбоев
- 0Отчётность по ходу. Скилл ничего не сообщает по ходу работы
- 20Когда включается. Не сказано, при каком запросе скилл включается
- 30Повторный запуск. Изменяющих операций: 1, без проверки текущего состояния
- 40Согласованность. Имя во frontmatter (alphagenome-variant-impact-score) не совпадает с папкой (alphagenome_variant_impact_score)
- 60Результат и критерий готовности. Формат результата описан, критерия завершения нет
- 70Входы и предусловия. Входные данные и предусловия перечислены
- 70Стоимость исполнения. Тело инструкции 4064 токенов
- 100Шаги. Шагов: 40
- medium Правила безопасности и запреты внутри скилла: их место в системном промпте, здесь они не защищают
- low Ответ описан самодельной разметкой (6 тегов): типизированный вызов надёжнее
Всё перечисленное измерено по тексту скилла, а не оценено моделью: цифры проверяемы. Вес параметра тем больше, чем чаще из-за него процесс встаёт.
Сигналы качества
- +5В description нет примеров фраз, по которым скилл должен срабатывать
- +4Описание не говорит, когда скилл НЕ применять (ложные срабатывания)
- +1Лицензия не указана
- +2Инструкции на одном языке
- +3Длина description 360 символов: достаточно сигнала, не съедает бюджет
- +4Структура: 14 заголовков
- +3Пошаговые инструкции: 40 пунктов
- +3Формат ответа описан явно
- +4Есть примеры (7 блоков кода)
- +3Все 1 скриптов описаны в инструкциях
База качества 70; замечания lint вычитаются, сигналы прибавляют до 100. Итог: 72.