SKILLEMALL.ai

BD lamindb

Этот навык следует использовать при работе с LaminDB, фреймворком данных с открытым исходным кодом для биологии, который делает данные доступными для запросов, отслеживаемыми, воспроизводимыми и соответствующими принципам FAIR. Используйте при управлении биологическими наборами данных (scRNA-seq, пространственные данные, проточная цитометрия и т. д.), отслеживании вычислительных рабочих процессов, курировании и проверке данных с использованием биологических онтологий, создании озер данных или обеспечении отслеживаемости данных и воспроизводимости в биологических исследованиях. Охватывает управление данными, аннотирование, онтологии (гены, типы клеток, заболевания, ткани), проверку схемы, интеграцию с менеджерами рабочих процессов (Nextflow, Snakemake) и платформами MLOps (W&B, MLflow) и стратегии развертывания.

машинный переводПоказать оригиналСкрыть оригинал«This skill should be used when working with LaminDB, an open-source da…»

This skill should be used when working with LaminDB, an open-source data framework for biology that makes data queryable, traceable, reproducible, and FAIR. Use when managing biological datasets (scRNA-seq, spatial, flow cytometry, etc.), tracking computational workflows, curating and validating data with biological ontologies, building data lakehouses, or ensuring data lineage and reproducibility in biological research. Covers data management, annotation, ontologies (genes, cell types, diseases, tissues), schema validation, integrations with workflow managers (Nextflow, Snakemake) and MLOps platforms (W&B, MLflow), and deployment strategies.

synthetic-sciences/OpenScience Agent Skills автор: synthetic-sciences Apache-2.0 7 файлов тело ≈ 3 404 токенов Открыть источникgithub.com↗ проанализирован 5 дн назад

Этот навык следует использовать при работе с LaminDB, фреймворком данных с открытым исходным кодом для биологии, который делает данные доступными для…

Как процесс D 37/100 · Процесс не доведён — слабые места: результат и критерий готовности, когда включается, входы и предусловия

ПроцедураGoogle CloudИнфраструктураДанные и аналитикатип и темы размечены автоматически по тексту скилла
JSON
Технический рейтинг
B
90/100
безопасность, качество, тесты
Безопасность 60%
90
Качество 40%
89
Прогон на моделях
не было
Процессный рейтинг
D
37/100
Процесс не доведён
Результат и критерий готовности вес 14
0
Входы и предусловия вес 11
0
Ошибки и развилки вес 10
0
три самых слабых из десяти параметров · все десять

Чем это грозит

Находки средней серьёзности: скорее всего скилл честный, но прочитайте, что именно насторожило сканер.

Опасные команды средняя серьёзность

Ниже описан худший случай для этой категории. Здесь находка средней серьёзности: guard увидел признак, но не доказательство.

Если установить

Скилл содержит команды, которые удаляют файлы, переписывают диски или исполняют код, скачанный из сети. Агент может выполнить их без вопроса, если считает, что так требует инструкция.

Автору

Замените разрушительные команды на безопасные аналоги с подтверждением, ограничьте область действия конкретной папкой и не тяните код через curl | bash: укажите версию и контрольную сумму.

Как улучшить

    Для прогона на моделях — необязательно
    • Свои кейсы (evals/evals.json, 4–6 реальных запросов с ожидаемыми ответами): тогда полная проверка прогонит именно их, а не черновик от модели.
    • spec.yaml с триггерными фразами и утверждениями — контракт поведения для CI; `skilltest init` создаст шаблон.

    Находки guard · 2

    ✓ Критических и высоких находок нет

    Средние и низкие: 2
    • средняя Опасные команды cmd-privilege references/setup-deployment.md:362
      Повышение привилегий / права на запись для всех
      sudo chmod 755 /shared/cache/lamindb
    • средняя Опасные команды cmd-privilege references/setup-deployment.md:363
      Повышение привилегий / права на запись для всех
      sudo chown -R shared-user:shared-group /shared/cache/lamindb

    Просканировано файлов: 7. Улики замаскированы. Пометки в серых чипах объясняют, почему серьёзность понижена.

    По спецификации Agent Skills

    ✓ По спецификации Agent Skills замечаний нет

    Процессный рейтинг: все десять параметров 37/100

    • 0Результат и критерий готовности. Не сказано, что считать результатом
    • 0Входы и предусловия. Не сказано, что нужно иметь на входе
    • 0Ошибки и развилки. Линейный процесс без обработки сбоев
    • 0Отчётность по ходу. Скилл ничего не сообщает по ходу работы
    • 20Когда включается. Не сказано, при каком запросе скилл включается
    • 30Повторный запуск. Изменяющих операций: 12, без проверки текущего состояния
    • 60Инструменты и файлы. Используются инструменты (python), но во frontmatter они не объявлены
    • 60Шаги. Шагов: 143, расплывчатых формулировок: 4
    • 100Согласованность. Имя и обязательные поля на месте
    • 100Стоимость исполнения. Тело инструкции 3404 токенов

    Всё перечисленное измерено по тексту скилла, а не оценено моделью: цифры проверяемы. Вес параметра тем больше, чем чаще из-за него процесс встаёт.

    Сигналы качества

    • +5В description нет примеров фраз, по которым скилл должен срабатывать
    • +4Описание не говорит, когда скилл НЕ применять (ложные срабатывания)
    • +3Формат ответа не описан: модель каждый раз решает сама
    • +2Инструкции на одном языке
    • +3Длина description 650 символов: достаточно сигнала, не съедает бюджет
    • +4Структура: 19 заголовков
    • +3Пошаговые инструкции: 143 пунктов
    • +4Есть примеры (4 блоков кода)
    • +4Справочные файлы упоминаются в инструкциях (6 из 6)
    • +1Лицензия указана

    База качества 70; замечания lint вычитаются, сигналы прибавляют до 100. Итог: 89.