Рейтинг скиллов
373 скилла. Оценка A–F складывается из безопасности (60%) и качества (40%), тесты дают бонус. Рейтинг пополняется автоматически из открытых каталогов.
ПроизводствоЛогистика и складЗакупки и снабжениеКачество и контрольКонтакт-центрВыездные работыФинансыПоддержка клиентовотраслевые подборки
| # | Оценка | Скилл | Баллы ▾ | Безоп. | Качество | Процесс | Тесты | Популярность | Обновлён |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | A | Полный конвейер молекулярного докинга. Подготовка мишени, обнаружение кармана, докинг белок-лиганд (DiffDock/Vina), оценка, анализ взаимодействий и ранжирование поз. | 100 | 99 | B | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 2 | A | Анализ научных файлов в более чем 200 форматах с глубиной, запрашиваемой пользователем. Определение типа файла, оценка структуры, качества и статистики, создание отчетов или визуализаций только по зап | 100 | 95 | B | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 3 | A | Запрос к Reactome REST API для анализа путей, обогащения, сопоставления генов и путей, путей заболеваний, молекулярных взаимодействий, анализа экспрессии для исследований системной биологии. | 100 | 95 | C | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 4 | A | Выполнение анализа путей и обогащения генных наборов на списках генов или ранжированных данных генов с последующей интерпретацией результатов. Используйте, когда у пользователя есть набор генов (диффе | 100 | 94 | D | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 5 | A | Эффективный инструмент поиска по базе данных препринтов bioRxiv. Используйте этот навык при поиске препринтов по наукам о жизни по ключевым словам, авторам, диапазонам дат или категориям, получении ме | 100 | 95 | C | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 6 | A | Запрос к NCBI Gene через E-utilities/Datasets API. Поиск по символу/ID, получение информации о гене (RefSeqs, GO, локации, фенотипы), пакетный поиск для аннотации генов и функционального анализа. | 100 | 95 | C | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 7 | A | Запрос к openFDA API для получения данных о лекарствах, устройствах, побочных эффектах, отзывах, регуляторных заявках (510k, PMA), идентификации веществ (UNII) для анализа регуляторных данных FDA и ис | 100 | 95 | C | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 8 | A | Установка или удаление сторонних openscience-навыков из публичного git-репозитория. Используйте, когда пользователь говорит "добавить этот навык <url>", "установить навык <url>" или "удалить навык <na | 100 | 94 | C | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 9 | A | Единый Python-интерфейс для более чем 40 биоинформатических сервисов. Используйте при запросе к нескольким базам данных (UniProt, KEGG, ChEMBL, Reactome) в одном рабочем процессе с согласованным API. | 100 | 95 | C | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 10 | A | Набор инструментов оператора для пакетных рабочих процессов nf-core/pacsomatic для парных опухолевых и нормальных образцов из входных данных BAM. Используйте этот навык, когда пользователю нужно прове | 100 | 96 | B | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 11 | A | Определение генных регуляторных сетей (GRN) по данным экспрессии генов с использованием масштабируемых алгоритмов (GRNBoost2, GENIE3). Используйте при анализе транскриптомных данных (bulk RNA-seq, sin | 100 | 95 | C | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 12 | A | metabolomics-workbench-databaseИнтеграцияДанные и аналитикаsynthetic-sciences/OpenScienceAgent Skills Доступ к NIH Metabolomics Workbench через REST API (более 4200 исследований). Поиск метаболитов, номенклатуры RefMet, данных MS/NMR, поиск по m/z, метаданные исследований для метаболомики и открытия б | 100 | 92 | C | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 13 | A | Запрос к ClinicalTrials.gov через API v2. Поиск испытаний по состоянию, препарату, местоположению, статусу или фазе. Получение деталей испытания по NCT ID, экспорт данных для клинических исследований | 100 | 92 | D | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 14 | A | Визуализация молекул для публикаций. 2D-структурные диаграммы (PNG/SVG), сетки молекул с аннотациями свойств, выделение каркаса, диаграммы взаимодействий белок-лиганд и интерактивные 3D-виды. | 100 | 92 | D | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 15 | A | Интеграция с API protocols.io для управления научными протоколами. Этот навык следует использовать при работе с protocols.io для поиска, создания, обновления или публикации протоколов; управления шага | 100 | 92 | C | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 16 | A | Запрос к Open Targets Platform для ассоциаций мишеней с заболеваниями, открытия лекарственных мишеней, данных о достижимости/безопасности, генетических/омиксных данных, известных лекарств для идентифи | 100 | 92 | C | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 17 | A | Готовые к производству алгоритмы обучения с подкреплением (PPO, SAC, DQN, TD3, DDPG, A2C) с API в стиле scikit-learn. Используйте для стандартных RL-экспериментов, быстрого прототипирования и хорошо д | 100 | 92 | D | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 18 | A | Прогнозирование регуляторных признаков, структуры генов и экспрессии непосредственно из ДНК-последовательности с использованием размещенных трансформерных ДНК-языковых моделей Genomic Intelligence — б | 100 | 93 | C | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 19 | A | Запрос к API FRED (Federal Reserve Economic Data) для более чем 800 000 временных рядов экономических данных из более чем 100 источников. Доступ к ВВП, безработице, инфляции, процентным ставкам, обмен | 100 | 92 | D | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 20 | A | Интеграция с API электронных лабораторных журналов. Доступ к журналам, управление записями/вложениями, резервное копирование журналов, интеграция с Protocols.io/Jupyter/REDCap для программных рабочих | 100 | 92 | C | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 21 | A | Управляемый статистический анализ с выбором тестов и отчетностью. Используйте, когда вам нужна помощь в выборе подходящих тестов для ваших данных, проверке предположений, анализе мощности и результата | 100 | 92 | D | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 22 | A | Запрос и анализ научной литературы с использованием базы данных OpenAlex. Этот навык следует использовать при поиске научных статей, анализе тенденций исследований, поиске работ авторов или учреждений | 100 | 92 | C | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 23 | A | Запрос к REST API базы данных геномов Ensembl для более чем 250 видов. Поиск генов, получение последовательностей, анализ вариантов, сравнительная геномика, ортологи, прогнозы VEP для геномных исследо | 100 | 92 | D | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 24 | A | Запрос к PubChem через PUG-REST API/PubChemPy (110 млн+ соединений). Поиск по названию/CID/SMILES, получение свойств, поиск по сходству/подструктуре, биоактивность для хемоинформатики. | 100 | 92 | D | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 25 | A | Прямой доступ к UniProt через REST API. Поиск белков, получение FASTA, сопоставление ID, Swiss-Prot/TrEMBL. Для Python-рабочих процессов с несколькими базами данных предпочтительнее bioservices (едины | 100 | 92 | D | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 26 | A | Запрос к ChEMBL для получения данных о биологически активных молекулах и разработке лекарств. Поиск соединений по структуре/свойствам, получение данных о биоактивности (IC50, Ki), поиск ингибиторов, п | 100 | 92 | D | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 27 | A | Доступ к базе данных мутаций рака COSMIC. Запрос соматических мутаций, Cancer Gene Census, мутационных сигнатур, генных слияний для исследований рака и прецизионной онкологии. Требуется аутентификация | 100 | 92 | C | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 28 | A | Запрос к STRING API для белк-белковых взаимодействий (59 млн белков, 20 млрд взаимодействий). Анализ сетей, обогащение GO/KEGG, поиск взаимодействий, 5000+ видов для системной биологии. | 100 | 92 | D | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 29 | A | Доступ к API USPTO для поиска патентов/товарных знаков, истории рассмотрения (PEDS), назначений, цитирований, официальных уведомлений, TSDR для анализа интеллектуальной собственности и поиска предшест | 100 | 92 | D | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 30 | A | Запрос к каталогу NHGRI-EBI GWAS для ассоциаций SNP-признак. Поиск вариантов по идентификатору rs, заболеванию/признаку, гену, получение p-значений и сводных статистик для генетической эпидемиологии и | 100 | 92 | D | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 31 | A | Прямой доступ к REST API KEGG (только для академического использования). Анализ путей, картирование генов-путей, метаболические пути, лекарственные взаимодействия, преобразование идентификаторов. Для | 100 | 92 | D | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 32 | A | Доступ к ZINC (более 230 млн. покупаемых соединений). Поиск по идентификатору ZINC/SMILES, поиск по сходству, структуры, готовые к 3D-моделированию для стыковки, поиск аналогов для виртуального скрини | 100 | 92 | C | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 33 | A | Доступ к European Nucleotide Archive через API/FTP. Получение последовательностей ДНК/РНК, необработанных чтений (FASTQ), геномных сборок по доступу для геномики и биоинформатических конвейеров. Подде | 100 | 92 | C | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 34 | A | Высокопроизводительная среда обучения с подкреплением, оптимизированная для скорости и масштаба. Используйте, когда вам требуется быстрое параллельное обучение, векторизованные среды, мультиагентные с | 100 | 92 | D | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 35 | A | Используйте при работе с открытыми моделями микробиома от Outpost Bio — контрольными точками Waypoint (Waypoint-6m, Waypoint-45m, Waypoint-170m), корпусом предварительного обучения Atlas, эталонным на | 100 | 92 | C | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 36 | A | Набор инструментов для биологических данных. Анализ последовательностей, выравнивания, филогенетические деревья, метрики разнообразия (альфа/бета, UniFrac), ординация (PCoA), PERMANOVA, ввод/вывод FAS | 100 | 92 | C | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 37 | A | Набор инструментов для анализа NGS. Конвертация BAM в bigWig, контроль качества (корреляция, PCA, отпечатки), тепловые карты/профили (TSS, пики) для визуализации ChIP-seq, RNA-seq, ATAC-seq. | 100 | 92 | D | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 38 | A | Фильтры медицинской химии. Применение правил лекарственной пригодности (Lipinski, Veber), фильтров PAINS, структурных маркеров, метрик сложности для приоритизации соединений и фильтрации библиотек. | 100 | 92 | D | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 39 | A | Анализ дифференциальной экспрессии генов (Python DESeq2). Определение DE генов из подсчетов РНК-сек, тесты Вальда, коррекция FDR, вулкан/MA-графики для анализа РНК-сек. | 100 | 92 | C | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 40 | A | Набор инструментов для материаловедения. Кристаллические структуры (CIF, POSCAR), фазовые диаграммы, зонная структура, плотность состояний (DOS), интеграция с Materials Project, конвертация форматов д | 100 | 92 | D | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 41 | A | Библиотека Python для работы с файлами DICOM (Digital Imaging and Communications in Medicine). Используйте этот инструмент при чтении, записи или изменении медицинских изображений в формате DICOM, изв | 100 | 92 | D | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 42 | A | Библиотека для моделирования квантовой физики открытых квантовых систем. Используйте при изучении мастер-уравнений, динамики Линдблада, декогеренции, квантовой оптики или полости КЭД. Лучше всего подх | 100 | 93 | C | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 43 | A | Используйте этот инструмент при работе с наборами данных BIDS (Brain Imaging Data Structure): организация данных нейронаук и биомедицины (МРТ, ЭЭГ, МЭГ, iEEG, ПЭТ, микроскопия, NIRS, захват движения, | 100 | 92 | D | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 44 | A | Фреймворк для многокритериальной оптимизации. NSGA-II, NSGA-III, MOEA/D, Парето-фронты, обработка ограничений, эталоны (ZDT, DTLZ) для задач проектирования и оптимизации в инженерии. | 100 | 92 | D | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 45 | A | Фреймворк дискретно-событийного моделирования на основе процессов в Python. Используйте этот инструмент при построении моделей систем с процессами, очередями, ресурсами и событиями, зависящими от врем | 100 | 92 | D | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 46 | A | folklore-variant-evidenceПроцедураGitHubИИ и агентыДанные и аналитикаsynthetic-sciences/OpenScienceAgent Skills Получение утверждений о валидности генов и заболеваний от ClinGen для общедоступного гена или заболевания, а также обзор связанных с источником общедоступных доказательств и литературы для одного подд | 100 | 89 | C | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 47 | A | Интеграция с платформой Benchling R&D. Доступ к реестру (ДНК, белки), инвентарю, записям ELN, рабочим процессам через API, создание приложений Benchling, запрос Data Warehouse для автоматизации управл | 100 | 89 | D | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 48 | A | get-available-resourcesПроцедураДанные и аналитикаРазработкаsynthetic-sciences/OpenScienceAgent Skills Этот навык следует использовать в начале любой вычислительно интенсивной научной задачи для обнаружения и отчетности о доступных системных ресурсах (ядра ЦП, ГП, память, дисковое пространство). Он соз | 100 | 91 | C | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 49 | A | dnanexus-integrationИнтеграцияDockerИнфраструктураРазработкаsynthetic-sciences/OpenScienceAgent Skills Облачная платформа геномики DNAnexus. Создание приложений/апплетов, управление данными (загрузка/скачивание), Python SDK dxpy, запуск рабочих процессов, FASTQ/BAM/VCF для разработки и выполнения геном | 100 | 89 | D | — | ★ 3 914 | 12 ч назад | |
| 50 | A | Платформа Latch для биоинформатических рабочих процессов. Создание конвейеров с помощью Latch SDK, декораторов @workflow/@task, развертывание бессерверных рабочих процессов, LatchFile/LatchDir, интегр | 100 | 89 | C | — | ★ 3 914 | 12 ч назад |
Описания переведены автоматически; оригинал — на странице скилла.