SKILLEMALL.ai

Рейтинг скиллов

887 скиллов. Оценка A–F складывается из безопасности (60%) и качества (40%), тесты дают бонус. Рейтинг пополняется автоматически из открытых каталогов.

887
#ОценкаСкиллБаллы ▾Безоп.КачествоПроцессТестыПопулярностьОбновлён
251B
Балансировка, нормализация и трансформация матриц контактов Hi-C с использованием cooler и cooltools. Применение итеративной коррекции (ICE), вычисление ожидаемых значений и генерация наблюдаемых/ожид
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
252B
Рабочий процесс XCMS3 для предварительной обработки метаболомики LC-MS/MS. Включает обнаружение пиков, выравнивание времени удерживания, сопоставление (группировку) и заполнение пропусков. Используйте
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
253B
Расчет эффективности трансляции (TE) как отношения занятости рибосом к количеству мРНК. Используйте для сравнения регуляции трансляции между условиями или для идентификации генов с измененной трансляц
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
254B
MAGeCK (Model-based Analysis of Genome-wide CRISPR-Cas9 Knockout) для анализа полногеномных CRISPR-скринингов. Включает нормализацию подсчетов, ранжирование генов и анализ путей. Используйте для идент
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
255B
Ручной и автоматический гейтинг для определения клеточных популяций в проточной цитометрии. Включает прямоугольные, полигональные и основанные на данных гейты. Используйте для идентификации клеточных
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
256B
Проектирование гидовых РНК для экспериментов CRISPR-Cas9/Cas12a с использованием CRISPRscan и локальных алгоритмов оценки. Оценка гидовых РНК по активности на цели с использованием Rule Set 2 и моделе
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
257B
Сравнение матриц контактов Hi-C между условиями для выявления дифференциальных хроматиновых взаимодействий. Расчет логарифмических изменений в 2 раза, статистической значимости и визуализация дифферен
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
258B
Анализ целевой метаболомики с использованием MRM/SRM со стандартными кривыми. Включает абсолютную количественную оценку, валидацию метода и оценку качества. Используйте для количественной оценки специ
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
259B
Вывод вариантов последовательностей ампликонов (ASV) из секвенирования ампликонов 16S рРНК или ITS с помощью DADA2. Включает фильтрацию качества, обучение на ошибках, денойзинг и удаление химер. Испол
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
260B
Таксономическая классификация ASV с использованием референсных баз данных, таких как SILVA, GTDB или UNITE. Включает классификаторы наивного байесовского метода (DADA2, IDTAXA) и подходы точного сопос
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
261B
Предварительная обработка и гармонизация мультиомиксных данных перед интеграцией. Включает нормализацию, коррекцию пакетов, выравнивание признаков и обработку пропущенных значений для различных типов
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
262B
Similarity Network Fusion (SNF) для стратификации пациентов с использованием мультиомиксных данных. Интегрирует различные типы данных в единую сеть сходства пациентов. Используйте для стратификации па
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
263B
Предварительная обработка данных рибосомного профилирования, включая обрезку адаптеров, отбор по размеру, удаление рРНК и выравнивание. Используйте для подготовки ридов Ribo-seq к последующему анализу
9310082D—★ 3 04521 июл. 2026 г.
264B
Определение сетей межклеточной коммуникации по данным scRNA-seq с использованием CellChat, NicheNet и LIANA для анализа взаимодействий лиганд-рецептор. Используйте для определения взаимодействий лиган
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
265B
Поиск маркерных генов и аннотация типов клеток в одноклеточной РНК-секвенировании с использованием Seurat (R) и Scanpy (Python). Используйте для дифференциальной экспрессии между кластерами, идентифик
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
266B
Определение аллелей HLA по данным NGS с использованием OptiType, HLA-HD или arcasHLA для иммуногеномных приложений. Используйте для определения генотипа HLA для подбора трансплантата, прогнозирования
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
267B
Визуализация профилей числа копий, сегментов и сравнение между образцами. Создание изображений данных CNV, полученных от CNVkit, GATK или других инструментов, пригодных для публикации. Используйте для
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
268B
Проектирование библиотек CRISPR для генетических скринингов. Включает выбор sgRNA, состав библиотеки, дизайн контролей и заказ олигонуклеотидов. Используйте для проектирования пользовательских библиот
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
269B
Контроль качества и нормализация данных метаболомики. Включает коррекцию на основе контроля качества, удаление пакетных эффектов и методы трансформации данных. Используйте для коррекции технических ва
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
270B
Анализ альфа- и бета-разнообразия данных микробиома. Расчет богатства и равномерности внутри образца, а также межобразцового несоответствия с помощью phyloseq и vegan. Используйте для сравнения состав
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
271B
Контролируемая и неконтролируемая интеграция мультиомиксных данных с помощью mixOmics. Включает sPLS для попарной интеграции и DIABLO для дискриминантного анализа нескольких блоков. Используйте для ко
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
272B
Создание, управление и поиск спектральных библиотек для протеомики. Используйте при создании или работе со спектральными библиотеками для DIA-анализа. Включает генерацию библиотек на основе DDA, предс
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
273B
Проверка качества данных Ribo-seq путем проверки трехнуклеотидной периодичности и расчета смещений P-сайта. Используйте при оценке качества библиотеки или определении смещений считываний для последующ
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
274B
Интеграция нескольких образцов/партий scRNA-seq с использованием Harmony, scVI, Seurat anchors и fastMNN. Удаление технических вариаций при сохранении биологических различий. Используйте при интеграци
9310082D—★ 3 04521 июл. 2026 г.
275B
Обнаружение и удаление дублетов (несколько клеток, захваченных в одной капле) из данных одноклеточной РНК-секвенирования. Использует Scrublet (Python), DoubletFinder (R) и scDblFinder (R). Важный шаг
9310082D—★ 3 04521 июл. 2026 г.
276B
Совместный вызов генотипов по нескольким образцам с использованием GATK CombineGVCFs и GenotypeGVCFs. Важно для когортных исследований, популяционной генетики и использования VQSR. Используйте при вып
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
277B
Идентификация вероятных причинных вариантов в локусах GWAS с использованием SuSiE для регрессии суммы одиночных эффектов и FINEMAP для стохастического поиска. Вычисляет апостериорные вероятности включ
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
278B
Анализ дифференциального связывания с помощью DiffBind. Сравнение пиков ChIP-seq между условиями со статистической строгостью. Требует наличия реплик. Выводит дифференциально связанные регионы с измен
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
279B
Обнаружение структурных вариантов из длинных прочтений с использованием Sniffles, cuteSV и SVIM. Используйте при обнаружении делеций, вставок, инверсий, транслокаций или сложных перестроек из данных O
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
280B
Сопоставление метаболитов с биологическими путями с использованием KEGG, Reactome и MetaboAnalyst. Выполнение обогащения путей и топологического анализа. Используйте при интерпретации результатов мета
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
281B
Отслеживание бактериальных штаммов с помощью MASH, sourmash, fastANI и inStrain. Сравнение геномов, обнаружение контаминации и мониторинг вариаций на уровне штаммов. Используйте при необходимости разр
9310082D—★ 3 04521 июл. 2026 г.
282B
Анализ мультиомиксных факторов (MOFA2) для неконтролируемой интеграции нескольких модальностей данных. Идентифицирует общие и специфичные для вида источники вариации. Используйте при интеграции RNA-se
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
283B
Группировка белков и вывод на основе идентификации пептидов. Используйте при разрешении белковой неоднозначности из общих пептидов. Обрабатывает группы белков и контроль FDR на уровне белков с использ
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
284B
Обнаружение вариантов числа копий из таргетного секвенирования или экзомного секвенирования с помощью CNVkit. Поддерживает вызов CNV для пар опухоль-норма, только опухоль и зародышевой линии. Использу
9310082D—★ 3 04521 июл. 2026 г.
285B
Комплексный контроль качества данных проточной цитометрии и CyTOF. Охватывает стабильность скорости потока, дрейф сигнала, краевые события, исключение мертвых клеток и контроль качества партий. Исполь
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
286B
Чтение и манипулирование файлами стандарта проточной цитометрии (FCS). Включает загрузку данных, доступ к параметрам и базовое исследование данных. Используйте при загрузке и проверке данных проточной
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
287B
Обработка пар прочтений Hi-C с помощью pairtools. Разбор выравниваний, фильтрация дубликатов, классификация пар и генерация статистики контактов из данных секвенирования Hi-C. Используйте при обработк
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
288B
Вызов топологически ассоциированных доменов (TAD) из данных Hi-C с использованием индекса изоляции, HiCExplorer и других методов. Идентификация границ доменов и иерархической структуры доменов. Исполь
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
289B
Анализирует паттерны метилирования cfDNA для обнаружения рака с использованием cfMeDIP-seq или бисульфитного секвенирования с MethylDackel. Идентифицирует специфичные для рака сигнатуры метилирования
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
290B
Автоматическая аннотация типов клеток с использованием референсных методов, включая CellTypist, scPred, SingleR и Azimuth, для последовательной, воспроизводимой маркировки клеток. Используйте при авто
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
291B
Реконструкция деревьев клеточных линий из данных CRISPR-баркодного трассирования или митохондриальных мутаций. Используйте при изучении клональной динамики, решений клеточной судьбы или траекторий раз
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
292B
Анализ одноклеточной ATAC-seq с помощью Signac (R/Seurat) и ArchR. Обработка данных 10X Genomics scATAC, выполнение контроля качества, снижение размерности, кластеризация, вызов пиков и оценка активно
9310082D—★ 3 04521 июл. 2026 г.
293B
Статистические методы для вызова хитов в CRISPR-скринингах. Охватывает MAGeCK, BAGEL2, drugZ и пользовательские подходы для идентификации существенных генов и генов резистентности. Используйте при иде
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
294B
Обнаружение петель хроматина и точечных взаимодействий по данным Hi-C с использованием методов cooltools, chromosight и HiCCUPS-like. Идентификация петель, опосредованных CTCF, и контактов энхансер-пр
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
295B
Визуализация метагеномных профилей с использованием R (phyloseq, microbiome) и Python (matplotlib, seaborn). Создание столбчатых диаграмм, тепловых карт, графиков PCA и анализа разнообразия. Используй
9310082D—★ 3 04521 июл. 2026 г.
296B
Модификация белковых структур с использованием Biopython Bio.PDB. Используйте при преобразовании координат, удалении атомов или остатков, добавлении новых сущностей, изменении B-факторов и заполняемос
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
297B
Обнаружение сайтов паузы и остановки рибосом по данным Ribo-seq с разрешением до кодона. Используйте при изучении регуляции трансляции, идентификации сайтов паузы или анализе динамики трансляции на ур
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
298B
Загрузка, преобразование и манипулирование контактными матрицами Hi-C в формате cooler. Чтение файлов .cool/.mcool, преобразование из формата .hic, доступ к данным матрицы и экспорт в различные формат
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
299B
Обнаружение дифференциально метилированных регионов (DMR) с использованием тайлов methylKit, bsseq BSmooth и DMRcate. Используйте при идентификации смежных геномных регионов с различиями в метилирован
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
300B
Количественная оценка белков по данным масс-спектрометрии, включая методы без меток (LFQ, на основе интенсивности), изотопное мечение (TMT, iTRAQ) и метаболическое мечение (SILAC). Используйте при изв
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.

Описания переведены автоматически; оригинал — на странице скилла.