SKILLEMALL.ai

Рейтинг скиллов

887 скиллов. Оценка A–F складывается из безопасности (60%) и качества (40%), тесты дают бонус. Рейтинг пополняется автоматически из открытых каталогов.

887
#ОценкаСкиллБаллы ▾Безоп.КачествоПроцессТестыПопулярностьОбновлён
151B
Улучшает сборки и определяет варианты по данным Oxford Nanopore с помощью medaka. Использует нейронные сети, обученные на конкретных версиях бейскаллера. Используйте для улучшения сборок только из ONT
9410085B—★ 3 04521 июл. 2026 г.
152B
Определяет однонуклеотидные замены и индели по выровненным ридам с помощью bcftools mpileup и call. Используйте для обнаружения вариантов из BAM-файлов или для создания VCF из выравниваний.
9410085B—★ 3 04521 июл. 2026 г.
153B
Записывает биологические последовательности в файлы (FASTA, FASTQ, GenBank, EMBL) с помощью Biopython Bio.SeqIO. Используйте для сохранения последовательностей, создания новых файлов последовательност
9410085C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
154B
Генерирует статистику вариантов, конкордантность образцов и метрики качества с помощью bcftools stats и gtcheck. Используйте для оценки качества вариантов, сравнения образцов или обобщения содержимого
9410085C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
155B
Создает сашими-плоты, показывающие покрытие ридов RNA-seq и количество сплайс-соединений, с помощью ggsashimi или rmats2sashimiplot. Визуализирует дифференциальные сплайсинг-события с группировкой обр
9410085C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
156B
Предоставляет доступ к обширной базе данных лекарств DrugBank, включая свойства лекарств, взаимодействия, мишени, пути, химические структуры и фармакологические данные. Этот навык следует использовать
9410085D—★ 3 04521 июл. 2026 г.
157B
Читает, записывает и конвертирует файлы множественных выравниваний последовательностей с помощью Biopython Bio.AlignIO. Поддерживает форматы Clustal, PHYLIP, Stockholm, FASTA, Nexus и другие для филог
9410085C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
158B
Предоставляет доступ к фармакогеномным данным ClinPGx (преемник PharmGKB). Запрашивает взаимодействия ген-лекарство, рекомендации CPIC, функции аллелей для прецизионной медицины и принятия решений о д
9410084C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
159B
Отправляет и управляет протоколами в Ginkgo Bioworks Cloud Lab (cloud.ginkgo.bio), веб-интерфейсе для автономного выполнения лабораторных работ на Reconfigurable Automation Carts (RACs). Используйте,
9410084C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
160B
Обеспечивает соответствие HIPAA при работе с PHI (защищенной медицинской информацией). Используйте при написании кода, который получает доступ к данным о здоровье пользователя, журналам активности, за
9410084C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
161B
Конвертирует необработанные данные сигналов Nanopore (FAST5/POD5) в нуклеотидные последовательности с помощью бейскаллера Dorado. Охватывает выбор модели, ускорение на GPU, обнаружение модифицированны
9410085B—★ 3 04521 июл. 2026 г.
162B
Предоставляет доступ к базе данных ферментов BRENDA через SOAP API. Извлекает кинетические параметры (Km, kcat), уравнения реакций, данные по организмам и информацию о ферментах, специфичных к субстра
9410084C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
163B
Просмотр, запрос и понимание файлов вариантов VCF/BCF с помощью bcftools и cyvcf2. Используйте для проверки вариантов, извлечения конкретных полей или понимания структуры формата VCF.
9410085C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
164B
Извлекает текст и таблицы из PDF-файлов, заполняет формы, объединяет документы. Используйте при работе с PDF-файлами или когда пользователь упоминает PDF, формы или извлечение документов.
9410084C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
165B
Просматривает веб-страницы для выполнения любых задач — исследование тем, чтение статей, взаимодействие с веб-приложениями, заполнение форм, создание снимков экрана, извлечение данных и тестирование в
9410084C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
166B
Специализированный контроль качества для RNA-seq, включая обнаружение загрязнения рРНК, проверку направленности, покрытие гена и метрики целостности транскриптов. Используйте для проверки библиотек RN
9410085C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
167B
Предоставляет доступ к базе данных Human Metabolome Database (более 220 тыс. метаболитов). Поиск по названию/ID/структуре, получение химических свойств, данных биомаркеров, спектров ЯМР/МС, путей для
9410084C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
168B
Локальная альтернатива Google NotebookLM с открытым исходным кодом для исследований и анализа документов с помощью ИИ. Используйте при организации исследовательских материалов в блокноты, загрузке раз
9410084D—★ 3 04521 июл. 2026 г.
169B
Этот навык следует использовать при преобразовании научных статей в рекламные и презентационные форматы, включая интерактивные веб-сайты (Paper2Web), презентационные видео (Paper2Video) и постеры для
949592B—★ 3 04521 июл. 2026 г.
170B
Эффективное хранение и извлечение данных геномных вариантов с помощью TileDB. Масштабируемая загрузка VCF/BCF, инкрементальное добавление образцов, сжатое хранение, параллельные запросы и возможности
9410085D—★ 3 04521 июл. 2026 г.
171B
Используйте этот навык всякий раз, когда пользователь хочет создавать, читать, редактировать или манипулировать документами Word (.docx файлы). Триггеры включают: любое упоминание 'Word doc', 'word do
9410086D—★ 3 04521 июл. 2026 г.
172B
Используйте этот навык всякий раз, когда файл электронной таблицы является основным входным или выходным файлом. Это означает любую задачу, где пользователь хочет: открыть, прочитать, отредактировать
9410085C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
173B
Определите сети передачи патогенов и выявите вероятные пары передачи, используя алгоритмы TransPhylo и реконструкции вспышек. Оцените, кто кого заразил, на основе геномных и эпидемиологических данных.
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
174B
Предскажите структуры белков с использованием современных ML-моделей, включая AlphaFold3, ESMFold, Chai-1 и Boltz-1. Используйте при предсказании структур для новых белков, белковых комплексов или при
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
175B
Назначайте линии патогенов и отслеживайте варианты с помощью Nextclade и pangolin для вирусного надзора. Отслеживайте распространенность вариантов и выявляйте новые варианты, вызывающие озабоченность.
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
176B
Интерактивная аннотация типов клеток для данных IMC. Включает аннотацию на основе napari, маркировку на основе маркеров, генерацию обучающих данных и проверку аннотаций. Используйте при ручной аннотац
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
177B
Анализируйте межклеточную коммуникацию в данных пространственной транскриптомики с помощью анализа лиганд-рецептор с использованием Squidpy. Определите межклеточную сигнализацию, выявите пути коммуник
9310082B—★ 3 04521 июл. 2026 г.
178B
Оцените состав типов клеток в пятнах пространственной транскриптомики с помощью деконволюции на основе эталона. Используйте cell2location, RCTD, SPOTlight или Tangram для определения пропорций типов к
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
179B
Контроль качества, фильтрация, нормализация и отбор признаков для данных пространственной транскриптомики. Рассчитайте метрики QC, отфильтруйте пятна/клетки, нормализуйте подсчеты и определите высоков
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
180B
Визуализируйте данные пространственной транскриптомики с помощью Squidpy и Scanpy. Создавайте карты тканей с экспрессией генов, кластерами и аннотациями, наложенными на гистологические изображения. Ис
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
181B
Рассчитайте мутационную нагрузку опухоли на основе данных панели или WES с надлежащей нормализацией и клиническими порогами. Используйте при оценке пригодности к иммунотерапии или характеристике иммун
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
182B
Компенсация и преобразование данных для проточной цитометрии. Включает расчет матрицы компенсации, ее применение и биэкспоненциальное/арксинусное преобразование. Используйте при коррекции спектральног
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
183B
Анализируйте пространственные платформы высокого разрешения, такие как Slide-seq, Stereo-seq и Visium HD. Используйте при работе с субклеточным разрешением или пространственными данными высокой плотно
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
184B
Анализирует данные пространственной протеомики с платформ CODEX, IMC и MIBI, включая сегментацию клеток и колокализацию белков. Используйте при работе с данными мультиплексной визуализации, анализе пр
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
185B
Вычислите пространственную статистику для данных пространственной транскриптомики с помощью Squidpy. Рассчитайте I Морана, C Гири, пространственную автокорреляцию, анализ коокупаемости и обогащение со
9310082B—★ 3 04521 июл. 2026 г.
186B
Вызывайте структурные варианты (SV) из данных секвенирования коротких прочтений с помощью Manta, Delly и LUMPY. Обнаруживает делеции, вставки, инверсии, дупликации и транслокации, которые слишком вели
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
187B
Обнаруживайте и отслеживайте гены антимикробной резистентности с помощью AMRFinderPlus и ResFinder с эпидемиологическим контекстом. Отслеживайте тенденции резистентности и выявляйте новые паттерны рез
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
188B
Загружайте и предварительно обрабатывайте данные визуализации масс-цитометрии (IMC) и MIBI. Включает обработку MCD/TIFF, удаление горячих пикселей и нормализацию изображений. Используйте при начале ан
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
189B
Создавайте графы пространственных соседей для данных пространственной транскриптомики с помощью Squidpy. Вычисляйте k-ближайших соседей, триангуляцию Делоне и связность на основе радиуса для последующ
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
190B
Создавайте визуализации данных иммунного репертуара, подходящие для публикации, включая цирковые диаграммы, отслеживание клонов, диаграммы разнообразия и сетевые графы. Используйте при создании рисунк
9310082D—★ 3 04521 июл. 2026 г.
191B
Удаляйте пакетные эффекты из данных RNA-seq с помощью ComBat, ComBat-Seq, limma removeBatchEffect и SVA для неизвестных пакетных переменных. Используйте при коррекции пакетных эффектов в данных экспре
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
192B
Выполняйте многолокусное секвенирование (MLST), секвенирование основного генома (core genome MLST) и типирование штаммов на основе SNP для характеристики бактериальных изолятов с использованием mlst и
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
193B
Предскажите CRISPR сайты вне мишени с использованием алгоритмов Cas-OFFinder и CFD. Определите потенциальные непреднамеренные сайты расщепления в геноме и оцените специфичность направляющей РНК. Испол
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
194B
Сегментация клеток из мультиплексных изображений тканей. Охватывает глубокое обучение (Cellpose, Mesmer) и классические подходы для сегментации ядер и целых клеток. Используйте при извлечении одноклет
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
195B
Оценка и приоритизация неоантигенов и эпитопов по иммуногенности с использованием многофакторных моделей, сочетающих связывание MHC, процессинг, экспрессию и особенности последовательности. Ранжирован
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
196B
Прогнозирование связывания пептидов с MHC класса I и II с использованием нейросетевых моделей MHCflurry и NetMHCpan. Идентификация потенциальных Т-клеточных эпитопов из последовательностей белков. Исп
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
197B
Доступ и анализ предсказаний структуры белков AlphaFold. Используйте, когда предсказанные структуры нужны для белков без экспериментальных структур или для оценки уверенности (pLDDT).
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.
198B
Комплексная фильтрация вариантов, включая GATK VQSR, жесткие фильтры, выражения bcftools и интерпретацию метрик качества для SNP и инделов. Используйте при фильтрации вариантов по лучшим практикам GAT
9310082D—★ 3 04521 июл. 2026 г.
199B
Проверка, разделяют ли два признака общий причинный вариант в геномном локусе, с помощью байесовской коколокализации с coloc. Вычисляет апостериорные вероятности для общих и различных причинных вариан
9310082B—★ 3 04521 июл. 2026 г.
200B
Оценка причинно-следственных связей между воздействиями и исходами с использованием генетических вариантов в качестве инструментальных переменных с помощью TwoSampleMR. Реализует методы IVW, MR-Egger,
9310082C—★ 3 04521 июл. 2026 г.

Описания переведены автоматически; оригинал — на странице скилла.